More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1930 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0642  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.41 
 
 
669 aa  665    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1531  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.92 
 
 
618 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.499402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0398  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.56 
 
 
668 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3750  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.41 
 
 
669 aa  667    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3935  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.74 
 
 
668 aa  665    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3439  fumarate reductase flavoprotein subunit  56.08 
 
 
668 aa  672    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3883  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.91 
 
 
668 aa  666    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1257  fumarate reductase flavoprotein subunit  56.44 
 
 
631 aa  681    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0509  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.9 
 
 
674 aa  662    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  decreased coverage  0.000923774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.24 
 
 
668 aa  665    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0394  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.07 
 
 
666 aa  655    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3065  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.79 
 
 
619 aa  660    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1066  fumarate reductase flavoprotein subunit  56.4 
 
 
614 aa  659    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.191298  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0404  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.39 
 
 
668 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3621  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.39 
 
 
668 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0457  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.56 
 
 
666 aa  662    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0679  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.24 
 
 
669 aa  661    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4114  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.07 
 
 
674 aa  661    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000002449 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2459  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.05 
 
 
605 aa  700    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1999  fumarate reductase flavoprotein subunit  56.9 
 
 
619 aa  685    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000679701  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0615  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.41 
 
 
669 aa  665    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0403  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.39 
 
 
668 aa  660    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  hitchhiker  0.00648266 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1930  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 
595 aa  1213    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3220  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.9 
 
 
679 aa  654    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0637  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.41 
 
 
669 aa  665    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3960  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.74 
 
 
668 aa  666    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0127  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.05 
 
 
612 aa  688    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7734  normal  0.0470081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4076  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.57 
 
 
668 aa  665    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.212927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1493  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.74 
 
 
667 aa  632  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1777  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.78 
 
 
659 aa  611  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0395  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  51.11 
 
 
661 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000651077  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  50.76 
 
 
668 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2205  fumarate reductase flavoprotein subunit  50 
 
 
662 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  50.26 
 
 
662 aa  608  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0425  fumarate reductase flavoprotein subunit  49.58 
 
 
672 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1548  fumarate reductase flavoprotein subunit  49.92 
 
 
663 aa  596  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0458  fumarate reductase flavoprotein subunit  49.75 
 
 
663 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0433  fumarate reductase flavoprotein subunit  49.75 
 
 
663 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0857  fumarate reductase flavoprotein subunit  48.81 
 
 
662 aa  574  1.0000000000000001e-162  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  38.98 
 
 
584 aa  350  6e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.31 
 
 
566 aa  344  2e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  37.02 
 
 
568 aa  345  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.19 
 
 
582 aa  342  1e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.12 
 
 
598 aa  336  5.999999999999999e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  37.41 
 
 
567 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.69 
 
 
581 aa  334  2e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.96 
 
 
581 aa  333  4e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  36.1 
 
 
570 aa  332  1e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.91 
 
 
567 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.39 
 
 
578 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.71 
 
 
602 aa  330  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.39 
 
 
568 aa  329  8e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.84 
 
 
566 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.91 
 
 
567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.38 
 
 
599 aa  327  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.8 
 
 
575 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.14 
 
 
617 aa  326  6e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11584  fumarate reductase flavoprotein subunit  38.72 
 
 
583 aa  326  7e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.532611 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.09 
 
 
567 aa  325  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.29 
 
 
589 aa  323  5e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.29 
 
 
589 aa  323  5e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.72 
 
 
575 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.23 
 
 
575 aa  323  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.23 
 
 
575 aa  323  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.05 
 
 
606 aa  321  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36 
 
 
575 aa  317  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.25 
 
 
567 aa  316  8e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.84 
 
 
585 aa  316  8e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.37 
 
 
567 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.42 
 
 
579 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.74 
 
 
542 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  35.41 
 
 
567 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1675  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.45 
 
 
588 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.506283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.4 
 
 
588 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.94 
 
 
603 aa  313  5.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.34 
 
 
589 aa  312  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.43 
 
 
567 aa  311  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.97 
 
 
591 aa  310  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1224  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.35 
 
 
588 aa  310  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.19 
 
 
591 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.19 
 
 
591 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.19 
 
 
591 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0419  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.09 
 
 
598 aa  309  9e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000541529 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1234  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.54 
 
 
588 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.97 
 
 
591 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2197  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.2 
 
 
590 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.97 
 
 
591 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.37 
 
 
590 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.97 
 
 
591 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4704  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.98 
 
 
596 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.698636  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4621  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.98 
 
 
596 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.97 
 
 
591 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.97 
 
 
591 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01353  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.93 
 
 
588 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.97 
 
 
591 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.97 
 
 
591 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0343  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.51 
 
 
596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  unclonable  0.00000264119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2816  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.12 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572429  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.08 
 
 
592 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.46 
 
 
588 aa  307  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>