More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0826 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  275  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  52.67 
 
 
132 aa  169  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  47.33 
 
 
132 aa  159  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  53.08 
 
 
132 aa  158  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  58.91 
 
 
131 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  49.62 
 
 
132 aa  154  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  45.04 
 
 
143 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  43.75 
 
 
132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  51.59 
 
 
132 aa  153  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  42.19 
 
 
132 aa  153  9e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  53.44 
 
 
131 aa  152  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  55.2 
 
 
133 aa  152  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  49.21 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  44.53 
 
 
132 aa  150  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  49.22 
 
 
133 aa  148  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  47.33 
 
 
132 aa  148  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  50.79 
 
 
130 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  53.08 
 
 
133 aa  148  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  50.78 
 
 
134 aa  148  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  54.55 
 
 
133 aa  148  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  51.15 
 
 
133 aa  147  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  146  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  56.3 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  47.58 
 
 
129 aa  144  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  47.2 
 
 
130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  48.09 
 
 
132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  53.91 
 
 
132 aa  143  9e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  45.6 
 
 
132 aa  142  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  52.76 
 
 
143 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  47.66 
 
 
130 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  48.09 
 
 
132 aa  140  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  54.03 
 
 
131 aa  140  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  49.22 
 
 
134 aa  139  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  46.15 
 
 
138 aa  138  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  52.46 
 
 
131 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  52.85 
 
 
132 aa  137  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  52.94 
 
 
136 aa  136  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  50.4 
 
 
133 aa  136  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  43.85 
 
 
138 aa  136  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  52.03 
 
 
132 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  46.09 
 
 
138 aa  135  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  44.7 
 
 
133 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  43.2 
 
 
133 aa  132  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  44.27 
 
 
131 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  42.42 
 
 
133 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  41.54 
 
 
131 aa  128  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  44.44 
 
 
139 aa  123  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  44.44 
 
 
136 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  48.15 
 
 
134 aa  123  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  40.94 
 
 
152 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  44.44 
 
 
139 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  42.96 
 
 
138 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  43.2 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  36.09 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  35.34 
 
 
135 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  45.45 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  45 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  41.73 
 
 
131 aa  111  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  45.67 
 
 
130 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  43.41 
 
 
134 aa  106  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  41.32 
 
 
136 aa  106  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  40.62 
 
 
137 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  42.86 
 
 
160 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  42.06 
 
 
142 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  37.23 
 
 
137 aa  103  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  42.06 
 
 
140 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  40.16 
 
 
139 aa  100  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  38.21 
 
 
137 aa  99  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  36.22 
 
 
132 aa  99  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  40.94 
 
 
141 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  38.14 
 
 
136 aa  97.8  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  42.06 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  40.62 
 
 
128 aa  97.4  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  39.1 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  35.43 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  40.15 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  41.48 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  38.33 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  43.69 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  37.3 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  41.27 
 
 
126 aa  94.4  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  41.86 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  43.64 
 
 
138 aa  93.2  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  43.64 
 
 
138 aa  93.2  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  43.24 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  39.37 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  44.86 
 
 
138 aa  92.8  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  35.43 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  40.17 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2162  hypothetical protein  44.66 
 
 
134 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2136  hypothetical protein  44.66 
 
 
134 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  42.99 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  42.86 
 
 
139 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.98 
 
 
584 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  36.75 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  35.04 
 
 
141 aa  87.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  34.78 
 
 
145 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  34.65 
 
 
141 aa  87  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  39.26 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  33.85 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>