More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1559 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1559  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 698 aa  1414    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000474129  normal  0.225702 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1421  putative PAS/PAC sensor protein  27.29 
 
 		 687 aa  210  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.377844  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0567  putative PAS/PAC sensor protein  25.7 
 
 		 693 aa  204  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1157  putative PAS/PAC sensor protein  28.02 
 
 		 723 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148223 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0002  putative PAS/PAC sensor protein  27.42 
 
 		 690 aa  177  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1974  putative PAS/PAC sensor protein  27.38 
 
 		 701 aa  177  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0637  putative PAS/PAC sensor protein  30.27 
 
 		 716 aa  163  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  35.27 
 
 		 358 aa  140  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  37.24 
 
 		 389 aa  137  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  30.51 
 
 		 357 aa  134  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.31 
 
 		 364 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  30.74 
 
 		 469 aa  131  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1612  putative PAS/PAC sensor protein  38.76 
 
 		 305 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  28.79 
 
 		 471 aa  131  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  35.75 
 
 		 453 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.75 
 
 		 480 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 		 389 aa  128  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 405 aa  127  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  37.09 
 
 		 474 aa  127  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  35.51 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  36.89 
 
 		 452 aa  126  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  39.43 
 
 		 771 aa  125  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 		 359 aa  125  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  38.95 
 
 		 654 aa  124  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  33.84 
 
 		 1301 aa  124  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  35.78 
 
 		 848 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1154  putative PAS/PAC sensor protein  30.31 
 
 		 706 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.986646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  31.53 
 
 		 452 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.16 
 
 		 384 aa  121  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1236  metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 		 574 aa  120  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0497288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  35.39 
 
 		 387 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 		 462 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 		 361 aa  118  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  40.22 
 
 		 571 aa  118  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  32.66 
 
 		 643 aa  117  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 		 643 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 		 643 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 		 643 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 		 643 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  28.27 
 
 		 341 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  38.15 
 
 		 481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 		 298 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.53 
 
 		 491 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  30.74 
 
 		 539 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  35.64 
 
 		 876 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.2 
 
 		 841 aa  114  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 		 363 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  37.43 
 
 		 545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0208  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 		 229 aa  111  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  35.07 
 
 		 836 aa  111  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 		 513 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 		 647 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 		 432 aa  110  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  38.79 
 
 		 703 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  31.44 
 
 		 642 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 		 642 aa  109  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  38.79 
 
 		 703 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 635 aa  108  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.04 
 
 		 1125 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 		 642 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  35.94 
 
 		 518 aa  108  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 		 553 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  35.39 
 
 		 438 aa  108  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  30.33 
 
 		 407 aa  108  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  32.67 
 
 		 561 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.84 
 
 		 492 aa  107  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  35.61 
 
 		 373 aa  107  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  35.61 
 
 		 374 aa  107  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  35.61 
 
 		 377 aa  107  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  35.61 
 
 		 377 aa  107  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 545 aa  106  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 		 388 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 398 aa  106  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  36.88 
 
 		 1171 aa  106  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.02 
 
 		 506 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  34.12 
 
 		 792 aa  106  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  35.12 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  32.09 
 
 		 308 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  32.96 
 
 		 647 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 		 363 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  37.79 
 
 		 548 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  35.94 
 
 		 374 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0273  metal dependent phosphohydrolase  30.53 
 
 		 534 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.576727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  30.93 
 
 		 564 aa  105  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  32.82 
 
 		 550 aa  105  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 		 343 aa  105  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  33.87 
 
 		 712 aa  104  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  33.69 
 
 		 710 aa  104  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  31.17 
 
 		 652 aa  104  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2934  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  29.19 
 
 		 683 aa  104  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 		 430 aa  104  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.39 
 
 		 345 aa  104  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1136  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 		 391 aa  104  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  33.85 
 
 		 760 aa  103  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  35.98 
 
 		 650 aa  103  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  30.93 
 
 		 563 aa  103  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 		 618 aa  103  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.63 
 
 		 498 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>