More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1331 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 278 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  71.01 
 
 		 286 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  72.43 
 
 		 274 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  73.7 
 
 		 276 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  70.99 
 
 		 283 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  70.99 
 
 		 283 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  70.9 
 
 		 304 aa  401  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  66.79 
 
 		 291 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  67.03 
 
 		 283 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  70.57 
 
 		 275 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  67.84 
 
 		 289 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  64.55 
 
 		 273 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  62.5 
 
 		 276 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  71.48 
 
 		 283 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  57.56 
 
 		 279 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  56.78 
 
 		 278 aa  343  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  55.15 
 
 		 288 aa  333  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  49.45 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  48.68 
 
 		 282 aa  258  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  46.32 
 
 		 282 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  42.91 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  42.55 
 
 		 271 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 		 279 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  36.8 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  36.01 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  34.49 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 		 277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 291 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  36.58 
 
 		 288 aa  148  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.59 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  32.36 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  32.71 
 
 		 289 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  31.91 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 289 aa  135  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  35.36 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  31.09 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  31.09 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  31.09 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  31.09 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  31.09 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  31.09 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  28.27 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 314 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.47 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 345 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 290 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 283 aa  105  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4238  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.98 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>