More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0417 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  100 
 
 		 457 aa  940    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  57.8 
 
 		 471 aa  551  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  61.17 
 
 		 473 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  49.66 
 
 		 470 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 489 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  27.54 
 
 		 477 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 476 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  25.87 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  27.73 
 
 		 470 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 476 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 477 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 447 aa  96.3  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 456 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  24.75 
 
 		 447 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 		 453 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 457 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  23.59 
 
 		 450 aa  93.2  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 458 aa  92  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  23.32 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  26.93 
 
 		 397 aa  91.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 		 460 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 452 aa  89.7  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  26.04 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 383 aa  89.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 450 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 387 aa  88.2  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 385 aa  87  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 489 aa  87  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  23.77 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0156  radical SAM domain-containing protein  35.95 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  23.72 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  24.66 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  24.02 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  24.01 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  22.76 
 
 		 463 aa  83.2  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.47 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.18 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  24.31 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.12 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.12 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.85 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.85 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  27.52 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  24.03 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  24.86 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  22.83 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  27.58 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  25.09 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  22.96 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0165  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.263951  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  24.88 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  24.88 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  23.95 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  25.31 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  25.31 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  25.52 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  22.96 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  31.44 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  25.31 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  24.88 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  24.63 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  21.86 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  21.95 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.48 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1467  Radical SAM domain protein  23.02 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1494  Radical SAM domain protein  23.02 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0737  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  25.12 
 
 		 723 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.22 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.22 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.22 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.22 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>