More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5418 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5418  histidine kinase  100 
 
 		 789 aa  1546    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 757 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  35.97 
 
 		 799 aa  356  8.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 819 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  32.61 
 
 		 759 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 777 aa  337  7e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 797 aa  336  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 797 aa  336  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  32.71 
 
 		 797 aa  334  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  32.71 
 
 		 797 aa  334  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  32.71 
 
 		 797 aa  334  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  32.71 
 
 		 797 aa  334  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 795 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 795 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  32.54 
 
 		 797 aa  334  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 777 aa  333  8e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.83 
 
 		 784 aa  332  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  32.52 
 
 		 795 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 794 aa  330  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 828 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 829 aa  326  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 795 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 754 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 795 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 795 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  34.51 
 
 		 751 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  33.92 
 
 		 766 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 785 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 776 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6238  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 737 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0006  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 513 aa  178  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000267267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4653  histidine kinase  27.84 
 
 		 799 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.688546 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 363 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 377 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 377 aa  138  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0474  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 759 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.453015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3738  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 363 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524065  normal  0.172918 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4578  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 377 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3785  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 377 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.76138  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 377 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2916  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  32.38 
 
 		 543 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.833203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0500  sensor histidine kinase/response regulator  36.44 
 
 		 364 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.823251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0581  transmembrane sensor-like domain-containing protein  29.86 
 
 		 828 aa  128  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0428324  normal  0.0128662 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  36.89 
 
 		 364 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  36.89 
 
 		 365 aa  126  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  36.89 
 
 		 364 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  31.08 
 
 		 356 aa  126  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  36.89 
 
 		 364 aa  126  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  36.89 
 
 		 365 aa  126  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  36.89 
 
 		 365 aa  126  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  36.89 
 
 		 365 aa  126  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 941 aa  120  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 854 aa  119  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7663  histidine kinase  32.76 
 
 		 639 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0505  Signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 417 aa  115  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 645 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92156  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  31.75 
 
 		 346 aa  114  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 449 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  25.38 
 
 		 584 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0634  histidine kinase  28.89 
 
 		 450 aa  110  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 486 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1749  ATPase domain-containing protein  31.65 
 
 		 602 aa  109  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 423 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3938  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 350 aa  108  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  31.8 
 
 		 604 aa  108  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0496  phosphate regulon sensor kinase PhoR  33.47 
 
 		 419 aa  108  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 458 aa  108  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  29.38 
 
 		 451 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1263  histidine kinase  31.58 
 
 		 346 aa  107  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 422 aa  107  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3758  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 408 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  30.09 
 
 		 363 aa  107  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1532  histidine kinase  32.81 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.628543  normal  0.374808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0757  two component sensor histidine kinase  29.44 
 
 		 435 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  32.64 
 
 		 510 aa  105  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 482 aa  105  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2005  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 408 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.343751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2715  sensor histidine kinase/response regulator  30.17 
 
 		 393 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  32.1 
 
 		 352 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2145  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 408 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2448  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.29 
 
 		 393 aa  103  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.760608  hitchhiker  0.00120668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0177  histidine kinase  28.53 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0167  histidine kinase  28.81 
 
 		 407 aa  103  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114642  normal  0.326562 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  26.6 
 
 		 598 aa  103  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1617  histidine kinase  28.11 
 
 		 376 aa  102  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2770  histidine kinase  33.64 
 
 		 418 aa  102  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  28.85 
 
 		 433 aa  102  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 444 aa  102  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  31.17 
 
 		 443 aa  102  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0263  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 338 aa  101  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 790 aa  100  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  32 
 
 		 591 aa  101  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 473 aa  101  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2109  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 408 aa  101  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 520 aa  100  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 591 aa  100  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4186  histidine kinase  34.31 
 
 		 526 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>