261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4496 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4496  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 298 aa  591  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.650422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6083  2-dehydropantoate 2-reductase  76.51 
 
 		 298 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  73.83 
 
 		 298 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6133  2-dehydropantoate 2-reductase  63.09 
 
 		 298 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0942  2-dehydropantoate 2-reductase  62.8 
 
 		 297 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6421  2-dehydropantoate 2-reductase  63.09 
 
 		 298 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6450  2-dehydropantoate 2-reductase  62.42 
 
 		 298 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5585  2-dehydropantoate 2-reductase  62.42 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5949  2-dehydropantoate 2-reductase  62.42 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5159  2-dehydropantoate 2-reductase  61.74 
 
 		 298 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3136  2-dehydropantoate 2-reductase  63.14 
 
 		 296 aa  364  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1469  2-dehydropantoate 2-reductase  62.8 
 
 		 296 aa  362  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3174  2-dehydropantoate 2-reductase  62.37 
 
 		 296 aa  362  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00987338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2289  2-dehydropantoate 2-reductase  58.9 
 
 		 296 aa  348  8e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974409  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  58.9 
 
 		 295 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  58.9 
 
 		 319 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12593  2-dehydropantoate 2-reductase  55.27 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.510267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0833  2-dehydropantoate 2-reductase  46.26 
 
 		 297 aa  228  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  40.28 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2165  2-dehydropantoate 2-reductase  36.33 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2219  2-dehydropantoate 2-reductase  42.15 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205933  normal  0.043559 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2676  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2622  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  30.95 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.42 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2153  2-dehydropantoate 2-reductase  26.03 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  32.29 
 
 		 298 aa  99.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  29.31 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.97 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.86 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  31.61 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 		 316 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  30.85 
 
 		 345 aa  92.8  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 		 301 aa  92.4  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  31.46 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  31.35 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  31.31 
 
 		 317 aa  89  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  29.87 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  27.42 
 
 		 306 aa  85.9  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  30.69 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  30.13 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  26.32 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  26.81 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  31.01 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  26.01 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  29.6 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  26.78 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  29.19 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  27.19 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  26.44 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  27.19 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  27.19 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  32.22 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  27.96 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  27.54 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  29.94 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  26.95 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  25.99 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  29.76 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  29.5 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  24.08 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  27.18 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  27.6 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  26.88 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  30.1 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  27.6 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  28.93 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  24.74 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  25.94 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  26.44 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  29.38 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  28 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  26.95 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  26.5 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  29.06 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  28.17 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  27.57 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  30.31 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  24.65 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  25.83 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  29.47 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  27.67 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  24.68 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  24.68 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>