More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0799 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0799  citrate synthase  100 
 
 		 261 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4823  citrate synthase  89.88 
 
 		 261 aa  454  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5380  citrate synthase  83.14 
 
 		 261 aa  437  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4697  citrate synthase  59.35 
 
 		 259 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0986  citrate synthase  60.64 
 
 		 259 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.879919 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4477  citrate synthase  46.75 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6318  citrate synthase  42.68 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2009  citrate synthase  38.68 
 
 		 261 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.884105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1313  citrate synthase  36.07 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1194  citrate synthase  38.34 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3867  citrate synthase  32.53 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5653  citrate synthase  34.92 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4946  citrate synthase  40.17 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.094047  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2022  citrate synthase  34.62 
 
 		 267 aa  141  9e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.275146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4677  citrate synthase  37.61 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4268  citrate synthase  35.32 
 
 		 265 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0045  citrate synthase  33.6 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1379  citrate synthase  28.17 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1039  citrate synthase  29.2 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6294  citrate synthase  28.75 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1832  Citrate synthase  31.19 
 
 		 289 aa  92.8  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0399593  normal  0.514801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3119  citrate synthase  28.3 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2728  citrate synthase  27.23 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4159  citrate synthase  31.25 
 
 		 275 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4144  citrate synthase  27.31 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00479182  normal  0.482128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4959  citrate synthase  27.16 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4041  citrate synthase  30.74 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4153  citrate synthase  30.74 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4826  citrate synthase  29.69 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538489  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4013  citrate synthase  28.12 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2128  citrate synthase  25.1 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8311  citrate synthase  28.27 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6289  citrate synthase  27.71 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.18 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  27.27 
 
 		 373 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0447  Citrate synthase-like protein  26.03 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000621018  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  27.27 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.43 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  27.92 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.58 
 
 		 375 aa  62  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  25.33 
 
 		 373 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  25.33 
 
 		 373 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  24.67 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  27.98 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  30.43 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1570  citrate (Si)-synthase  26.34 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00021591  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.19 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7229  citrate synthase 2  26.03 
 
 		 364 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  29.02 
 
 		 429 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  25.5 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  30.1 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  25.13 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  30.1 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0586  citrate synthase  26.83 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  24.47 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  24.55 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0260  citrate synthase I  24.49 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.419168  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  24.47 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  29.52 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  26.29 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  24.77 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0115  citrate synthase 2  25.11 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  28.21 
 
 		 368 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  31.38 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  24.3 
 
 		 375 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0081  citrate synthase 2  25.57 
 
 		 369 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  24.61 
 
 		 375 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  26.67 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  28.43 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  29.63 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  26.11 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  33.87 
 
 		 410 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2208  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.7 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.539974  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  30.29 
 
 		 413 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3747  Citrate synthase  29.31 
 
 		 454 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4790  methylcitrate synthase  29.65 
 
 		 385 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  27.59 
 
 		 434 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  23.87 
 
 		 382 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  31.88 
 
 		 545 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0106  citrate synthase I  25.35 
 
 		 426 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.43 
 
 		 382 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0798  citrate synthase 3  28.64 
 
 		 370 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.036744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  25.93 
 
 		 362 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02719  methylcitrate synthase  27.55 
 
 		 384 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  26.6 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33820  citrate synthase 2  25.82 
 
 		 389 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  28.16 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1351  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  23.2 
 
 		 610 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02436  ATP citrate lyase, subunit 1, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10650)  23.72 
 
 		 655 aa  53.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3511  methylcitrate synthase  28.43 
 
 		 390 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  28.1 
 
 		 410 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0953  methylcitrate synthase  26.05 
 
 		 377 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1090  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  24.62 
 
 		 610 aa  53.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  26.02 
 
 		 442 aa  53.5  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  24.27 
 
 		 386 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0097  citrate synthase  24.88 
 
 		 426 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0802276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  26.79 
 
 		 388 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0730  citrate synthase  24.88 
 
 		 398 aa  53.1  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.554862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1306  ATP citrate lyase subunit 2  24.24 
 
 		 610 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.205597  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  26.05 
 
 		 428 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>