More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0779 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  669    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  70.68 
 
 		 328 aa  465  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  72.67 
 
 		 326 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  58.68 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  59.74 
 
 		 325 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  56.72 
 
 		 324 aa  355  8.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  51.51 
 
 		 339 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  48.7 
 
 		 337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  48.84 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  48.84 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.17 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  46.62 
 
 		 356 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  48.69 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  45.85 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  46.15 
 
 		 328 aa  288  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  44.65 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  48 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  43.96 
 
 		 328 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.17 
 
 		 328 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.14 
 
 		 327 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.4 
 
 		 335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.48 
 
 		 328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.67 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.67 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.92 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  45.67 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  44 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  45.67 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.68 
 
 		 358 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  45.85 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.9 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  41.85 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  44.37 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  46.49 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.48 
 
 		 333 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  45.39 
 
 		 325 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.18 
 
 		 314 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.22 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  44.84 
 
 		 334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  43.61 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.68 
 
 		 344 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  44.26 
 
 		 335 aa  272  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  44.65 
 
 		 326 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.55 
 
 		 324 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46.23 
 
 		 330 aa  271  9e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46.23 
 
 		 330 aa  271  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.9 
 
 		 331 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  44.82 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  44.78 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.3 
 
 		 336 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  42.3 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.08 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  43.12 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  45.85 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  43.12 
 
 		 324 aa  269  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  45 
 
 		 335 aa  269  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  43.65 
 
 		 341 aa  268  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.2 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  44.74 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  44.81 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  42.58 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  44.1 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.59 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.04 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  44.05 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  43.69 
 
 		 343 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  44.48 
 
 		 338 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  43.93 
 
 		 332 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  45.42 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  43.73 
 
 		 330 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  43.09 
 
 		 322 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4101  extra-cytoplasmic solute receptor  44.27 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0889008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  39.68 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  45.82 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.81 
 
 		 304 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.07 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  44.1 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.63 
 
 		 331 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  43.43 
 
 		 331 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.47 
 
 		 334 aa  262  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.81 
 
 		 325 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  46.1 
 
 		 349 aa  262  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  42.33 
 
 		 326 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  41 
 
 		 334 aa  262  6.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  44.33 
 
 		 341 aa  261  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.37 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  40.44 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  45.03 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  41.8 
 
 		 331 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5251  hypothetical protein  41.59 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.62 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  44.74 
 
 		 329 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  44 
 
 		 330 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  44.67 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  42.12 
 
 		 337 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  41.49 
 
 		 330 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.62 
 
 		 331 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.36 
 
 		 344 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.26 
 
 		 345 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>