More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0262 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0262  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5973  ABC transporter related  76.28 
 
 		 254 aa  391  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3658  ABC transporter related  75.7 
 
 		 254 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3978  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  76.1 
 
 		 254 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1221  decreased coverage  0.00203887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  65.73 
 
 		 254 aa  349  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  58.87 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  52.21 
 
 		 264 aa  270  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  51.41 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  47.41 
 
 		 256 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  47.79 
 
 		 270 aa  237  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  48 
 
 		 259 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  47.2 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  47.6 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  47.58 
 
 		 256 aa  234  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  48 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  46.96 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  45.28 
 
 		 278 aa  229  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  47.64 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  46.27 
 
 		 273 aa  228  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  45.6 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 		 256 aa  228  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  45.38 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 256 aa  225  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  44.27 
 
 		 257 aa  225  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  45.85 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  47.77 
 
 		 271 aa  224  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  45.2 
 
 		 261 aa  224  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  46.77 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  44.4 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  46.37 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  43.43 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  45.38 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  43.64 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  45.16 
 
 		 258 aa  221  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  44.66 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  46.77 
 
 		 293 aa  221  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  46.8 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  44.85 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.05 
 
 		 279 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  43.95 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  44.18 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  45.85 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  44.05 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  45.31 
 
 		 271 aa  219  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  42.8 
 
 		 256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  43.37 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  45.63 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  43.75 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  44 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  45.42 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  42.91 
 
 		 284 aa  219  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  43.82 
 
 		 258 aa  218  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  43.78 
 
 		 260 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  45.97 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  45.02 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  44.35 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  44.35 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  44.35 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  44.35 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  42.86 
 
 		 274 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  43.37 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  43.6 
 
 		 612 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  43.37 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.95 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  46 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  41.7 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  44.62 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  42.57 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  44.79 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  43.2 
 
 		 259 aa  215  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  45.02 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  45.67 
 
 		 280 aa  215  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  42.4 
 
 		 263 aa  214  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  44.71 
 
 		 269 aa  214  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  43.08 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  44.35 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  45.24 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  46.36 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  44.09 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  44.09 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  44.05 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  44.09 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  46.37 
 
 		 589 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  41.73 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  42.46 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  46.43 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  44.62 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  44.53 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  42.57 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  43.82 
 
 		 250 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  45.28 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  44.71 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  43.37 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  43.82 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  42.46 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  42.97 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>