More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1206 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1206  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 433 aa  883    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1016  homoserine dehydrogenase  96.07 
 
 		 433 aa  806    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00327317  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_989  homoserine dehydrogenase  97.92 
 
 		 433 aa  815    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  44.13 
 
 		 424 aa  356  5e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  45.01 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  44.55 
 
 		 430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  46.1 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  44.6 
 
 		 428 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  44.69 
 
 		 432 aa  342  8e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.47 
 
 		 436 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  45.45 
 
 		 427 aa  335  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  45.07 
 
 		 418 aa  334  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  41.44 
 
 		 438 aa  332  9e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 440 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  44.24 
 
 		 435 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  40.96 
 
 		 436 aa  329  6e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  42.69 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  40.84 
 
 		 436 aa  326  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  40.5 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  43.59 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  41.11 
 
 		 439 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  41.22 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  40.75 
 
 		 431 aa  317  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  42.17 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  41.75 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  40.73 
 
 		 431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  46.3 
 
 		 449 aa  306  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  41.81 
 
 		 437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  41.81 
 
 		 437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  41.13 
 
 		 441 aa  305  8.000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 		 438 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  41.77 
 
 		 439 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  40.09 
 
 		 438 aa  302  9e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  41.46 
 
 		 445 aa  301  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  39.91 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  40.5 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  39.57 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  40.52 
 
 		 436 aa  299  5e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  40.76 
 
 		 436 aa  299  6e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  44.32 
 
 		 414 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  41.24 
 
 		 440 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  41.53 
 
 		 427 aa  296  3e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 436 aa  296  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 432 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 432 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  41.47 
 
 		 436 aa  296  7e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  39.15 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  40.24 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  40.66 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  40.42 
 
 		 447 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  41.18 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  39.52 
 
 		 469 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  44.39 
 
 		 438 aa  293  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  40.42 
 
 		 439 aa  292  7e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  42.25 
 
 		 437 aa  292  9e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  40.42 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  40.42 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  40.42 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  41.3 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  40.33 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  40.86 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  40.55 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  40.37 
 
 		 443 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  40.42 
 
 		 442 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  40.52 
 
 		 448 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  40.42 
 
 		 442 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  40.79 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  38.11 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  41.99 
 
 		 442 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  40.28 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  39.54 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  42.82 
 
 		 435 aa  286  4e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  39.68 
 
 		 433 aa  286  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  38.85 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  41.5 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  41.5 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  41.5 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  41.5 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  41.5 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  41.5 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  41.5 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  39.53 
 
 		 437 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  38.43 
 
 		 448 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  40.46 
 
 		 429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 		 444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  40.14 
 
 		 445 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  40.79 
 
 		 439 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  39.1 
 
 		 441 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  40.79 
 
 		 439 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 453 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  40.38 
 
 		 433 aa  282  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  38.86 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 453 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  39.34 
 
 		 436 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  38.06 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>