More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4413 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4413  response regulator receiver protein  100 
 
 
177 aa  357  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.529624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 
628 aa  92  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
680 aa  85.1  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
1419 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
934 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
708 aa  81.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1478 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 
1548 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.29 
 
 
1407 aa  80.1  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4612  putative PAS/PAC sensor protein  39.13 
 
 
354 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.384861 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
696 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 
720 aa  74.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1297 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 
1431 aa  72.4  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
653 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
865 aa  71.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
701 aa  71.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
1965 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
519 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 
755 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0435  transcriptional regulator PhoB  34.13 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0441  transcriptional regulator PhoB  34.13 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  34.13 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  37.5 
 
 
459 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0454  transcriptional regulator PhoB  34.13 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0889  two component transcriptional regulator  34.06 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.147318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
1331 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0496  transcriptional regulator PhoB  34.13 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
1287 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5728  two component transcriptional regulator  34.06 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
697 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0893  DNA-binding response regulator OmpR  35.07 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
587 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00347  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoR (or CreC)  33.33 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.33 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0475  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0318  transcriptional regulator PhoB  33.33 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1391 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  32.26 
 
 
239 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2689  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  32.26 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000627834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  32.26 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  29.71 
 
 
236 aa  67.4  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0750  DNA-binding response regulator OmpR  35.71 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  31.45 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1574  DNA-binding response regulator OmpR  35.71 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
1330 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0993  DNA-binding response regulator OmpR  35.71 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3023  DNA-binding response regulator OmpR  35.71 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0975164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1208  phosphate regulon response regulator PhoB  30.65 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03440  putative DNA-binding response regulator PhoB  33.61 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
1184 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1252  DNA-binding response regulator OmpR  35.71 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1099  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662709  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  30 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1094  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0253  DNA-binding response regulator PhoB  33.9 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2446  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  36.72 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01026  response regulator  33.05 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
1501 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1125  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004385  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  33.05 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3387  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3452  two component transcriptional regulator  30 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00686704  hitchhiker  0.000158375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2160  two component transcriptional regulator  33.59 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71041  hitchhiker  0.000000282055 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2457  response regulator homolog PhoB (phosphate regulon transcriptional regulatory protein)  32.26 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  37.01 
 
 
236 aa  64.7  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2311  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  32.82 
 
 
725 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1789  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 
241 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2401  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 
241 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2405  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 
241 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343281  normal  0.0119317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
1559 aa  64.7  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  35.88 
 
 
243 aa  64.3  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3302  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.88 
 
 
229 aa  64.3  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  37.1 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1008  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.88 
 
 
229 aa  64.3  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 
882 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
653 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  29.84 
 
 
229 aa  63.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000855765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 
245 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  36.15 
 
 
245 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1041  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 
229 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.194422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 
1808 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  32.26 
 
 
229 aa  63.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2232  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  31.25 
 
 
227 aa  63.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.326614  normal  0.43086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>