More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2935 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 304 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0807  LysR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 297 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  54.2 
 
 		 294 aa  288  6e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1604  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218506 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51620  LysR family transcriptional regulator protein  36.48 
 
 		 301 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1692  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0673  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4995  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631415  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0589  LysR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1864  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1141  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387698 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  29.81 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  29.81 
 
 		 263 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3236  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.45 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  31.77 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  28.4 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  28.68 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  28.4 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1368  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114163 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26180  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1721  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0891841  normal  0.236435 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38680  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  28.17 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1671  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2625  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2736  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5818  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1472  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1497  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1473  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1889  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.37 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  27.99 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4486  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3883  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 305 aa  99.4  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 305 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3922  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6028  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 300 aa  99  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4012  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 298 aa  99  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  32.46 
 
 		 297 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  28.52 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  32.79 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0817  transcriptional regulator, LysR family  31.64 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4386  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.343439  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4318  LysR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.772143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0958  transcriptional regulator, LysR family  31.64 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.181705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3121  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739955  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04591  oxidative stress transcriptional regulator  32.13 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2595  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1592  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.030577  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  29.92 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5534  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162022  normal  0.470463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  29.92 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  29.92 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  29.92 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  29.2 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4822  putative transcriptional regulatory protein (nitrogen assimilation control protein)  30.4 
 
 		 331 aa  95.9  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.672498  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 303 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 303 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>