83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0695 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0695  Recombinase  100 
 
 
437 aa  883    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.736618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3120  recombinase  56.98 
 
 
430 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0625  Recombinase  55.94 
 
 
440 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0609  Recombinase  55.94 
 
 
440 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3086  Recombinase  56.26 
 
 
437 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.776561 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2288  recombinase  52.7 
 
 
544 aa  479  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3472  recombinase  49.77 
 
 
436 aa  477  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1166  hypothetical protein  45.35 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  21.45 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  23.59 
 
 
445 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25 
 
 
613 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  24.73 
 
 
441 aa  65.1  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  22.92 
 
 
445 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  22.52 
 
 
445 aa  63.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  23.26 
 
 
490 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  23.26 
 
 
412 aa  61.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  20.96 
 
 
479 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  21.32 
 
 
528 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  23.23 
 
 
665 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  21.32 
 
 
528 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  22.11 
 
 
527 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  23.1 
 
 
485 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  22.17 
 
 
561 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  22.99 
 
 
525 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  21.76 
 
 
519 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  20.51 
 
 
484 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  24.16 
 
 
513 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  20.51 
 
 
484 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  17.66 
 
 
489 aa  54.7  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  24 
 
 
525 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  22.13 
 
 
488 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  22.79 
 
 
534 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  23.78 
 
 
441 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  23.78 
 
 
441 aa  53.1  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  22.51 
 
 
534 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  17.89 
 
 
522 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  23.16 
 
 
509 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  23.01 
 
 
537 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  21.77 
 
 
539 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  19.13 
 
 
500 aa  51.2  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  20.96 
 
 
441 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  20.84 
 
 
547 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  20.42 
 
 
421 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  20.15 
 
 
474 aa  50.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  22.32 
 
 
462 aa  50.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  22.68 
 
 
443 aa  49.7  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  20.68 
 
 
487 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  22.22 
 
 
534 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  20.77 
 
 
521 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  16.96 
 
 
552 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  21.94 
 
 
534 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  23.05 
 
 
555 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  26.7 
 
 
484 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  21.94 
 
 
534 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  20.69 
 
 
517 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  22.15 
 
 
474 aa  47.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  22.1 
 
 
537 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  18.24 
 
 
542 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  22.73 
 
 
460 aa  47.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  18.24 
 
 
542 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  18.24 
 
 
542 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  21.14 
 
 
482 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  20.34 
 
 
475 aa  47.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  22.73 
 
 
322 aa  47  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  19.25 
 
 
522 aa  47  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  22.5 
 
 
532 aa  47  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  19.38 
 
 
612 aa  46.6  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  24.33 
 
 
445 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  23.4 
 
 
479 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  23.4 
 
 
479 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  19.76 
 
 
552 aa  46.6  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  22.26 
 
 
462 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  22.58 
 
 
462 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  21.65 
 
 
534 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  20.75 
 
 
506 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  20.95 
 
 
568 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  19.78 
 
 
444 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  23.75 
 
 
459 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.59 
 
 
498 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  19.54 
 
 
534 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  22.59 
 
 
540 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  18.29 
 
 
553 aa  43.9  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  28.57 
 
 
707 aa  43.9  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>