More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3880 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3880  Amidase  100 
 
 
508 aa  976    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777875  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2304  hypothetical protein  34.53 
 
 
469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0691  amidase  36.58 
 
 
505 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.771388  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2277  hypothetical protein  34.53 
 
 
469 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  40.44 
 
 
447 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1900  amidase  34.81 
 
 
490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  36.88 
 
 
469 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  34.06 
 
 
475 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1679  amidase  32.73 
 
 
500 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  34.53 
 
 
499 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4139  amidase  35.77 
 
 
483 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1302  amidase  33.74 
 
 
477 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7130  amidase  34.81 
 
 
489 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1685  amidase  35.24 
 
 
466 aa  170  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.96 
 
 
486 aa  168  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  35.01 
 
 
472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4838  Amidase  35.71 
 
 
469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  33.06 
 
 
496 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  32.46 
 
 
474 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  33.13 
 
 
491 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.8 
 
 
485 aa  162  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2578  amidase  33.26 
 
 
483 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1033  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.26 
 
 
492 aa  160  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7676  amidase  34.26 
 
 
471 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616001  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  31.73 
 
 
464 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5240  putative amidase  34.49 
 
 
485 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.273599 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1975  amidase  34.45 
 
 
470 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0873  amidase  34.46 
 
 
470 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.753798  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6669  amidase  34.71 
 
 
478 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  34.93 
 
 
463 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2400  indoleacetamide hydrolase  36.6 
 
 
467 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  32.08 
 
 
485 aa  157  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  34.51 
 
 
463 aa  157  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  32.16 
 
 
480 aa  156  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  32.37 
 
 
494 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.75 
 
 
486 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.98 
 
 
483 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  32.72 
 
 
494 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3317  amidase  32.83 
 
 
468 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.39 
 
 
485 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.15 
 
 
485 aa  154  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2627  amidase  34.04 
 
 
466 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0982  indoleacetamide hydrolase  35.5 
 
 
470 aa  154  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.682972  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  45.9 
 
 
477 aa  154  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0798  amidase  35.18 
 
 
485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.286428 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4006  amidase  34.56 
 
 
466 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525066  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  30.3 
 
 
470 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1020  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.72 
 
 
487 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00154188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3666  amidase  34.19 
 
 
466 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.66 
 
 
487 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3620  amidase  33.12 
 
 
473 aa  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  32.91 
 
 
469 aa  151  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  32.72 
 
 
469 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2281  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.67 
 
 
501 aa  150  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  36.77 
 
 
473 aa  150  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  32.52 
 
 
469 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.01 
 
 
486 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1782  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.38 
 
 
470 aa  149  9e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0932961 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3512  amidase  34.22 
 
 
466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.37 
 
 
489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3471  amidase  33.91 
 
 
465 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  34 
 
 
471 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5269  amidase  33.26 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357153  normal  0.248065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  29.74 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10833  amidase (Eurofung)  29.46 
 
 
543 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  33.06 
 
 
469 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0928  amidase  33.11 
 
 
466 aa  148  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.4 
 
 
491 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6767  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  36.33 
 
 
501 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.23 
 
 
482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.13 
 
 
461 aa  147  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3556  amidase  33.48 
 
 
473 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512755  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09141  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.36 
 
 
482 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  33.19 
 
 
494 aa  147  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  31.29 
 
 
462 aa  147  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6072  amidase  33.48 
 
 
471 aa  147  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02060  amidase, putative  34.28 
 
 
556 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.84 
 
 
486 aa  146  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.72 
 
 
475 aa  146  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.84 
 
 
486 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0853  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.31 
 
 
480 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  35.32 
 
 
459 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  32.24 
 
 
474 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  32.82 
 
 
494 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  32.82 
 
 
494 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  32.82 
 
 
494 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2838  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.54 
 
 
501 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  33.26 
 
 
494 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  28.93 
 
 
491 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0846  amidohydrolase, AtzE family  31.78 
 
 
464 aa  144  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.93 
 
 
475 aa  143  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  34.57 
 
 
480 aa  143  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  32.6 
 
 
494 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.98 
 
 
479 aa  143  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  29.79 
 
 
477 aa  143  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2081  amidase  33.55 
 
 
524 aa  143  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15821  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.51 
 
 
486 aa  143  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3194  amidase  30.88 
 
 
465 aa  143  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3453  amidase  30.88 
 
 
465 aa  143  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3332  amidase  30.88 
 
 
465 aa  143  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>