51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2020 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  544  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  96.58 
 
 		 263 aa  528  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  95.24 
 
 		 717 aa  504  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  90.49 
 
 		 266 aa  499  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  88.59 
 
 		 266 aa  484  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  90.87 
 
 		 717 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  90.08 
 
 		 717 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  87.43 
 
 		 183 aa  333  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2843  hypothetical protein  90.2 
 
 		 102 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00805434  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  41.96 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  40.78 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  39.69 
 
 		 746 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.85 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  38.43 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  38.17 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.96 
 
 		 599 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3055  hypothetical protein  82.61 
 
 		 94 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0517698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  36.07 
 
 		 746 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  36.07 
 
 		 746 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  31.56 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  31.55 
 
 		 749 aa  99  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  39.86 
 
 		 206 aa  95.9  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  31.68 
 
 		 667 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  31.75 
 
 		 955 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.39 
 
 		 970 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.6 
 
 		 970 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  32.18 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.29 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  37.1 
 
 		 201 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.52 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.94 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  30.85 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  26.13 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  29.53 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  29.44 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5495  Primase 2  35.83 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.15 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  31.71 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.61 
 
 		 304 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  33.85 
 
 		 317 aa  52.4  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  28.16 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  26.18 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.25 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  24.73 
 
 		 1002 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  27.15 
 
 		 723 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  36.36 
 
 		 692 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.57 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  27.84 
 
 		 1287 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  36.67 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2304  hypothetical protein  41.77 
 
 		 158 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0886627  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.38 
 
 		 400 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>