45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3783 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 184 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  47.8 
 
 		 201 aa  187  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 209 aa  70.9  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4325  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 197 aa  45.1  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 219 aa  45.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3660  resolvase domain-containing protein  42.55 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  20.67 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 324 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 236 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 207 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 219 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 185 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 216 aa  41.6  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  27.71 
 
 		 248 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 216 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 211 aa  41.2  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 194 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 194 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 194 aa  41.2  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 203 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4876  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 205 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>