More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3073 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 412 aa  834    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  45.32 
 
 		 420 aa  321  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  39.7 
 
 		 405 aa  302  9e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  39.16 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 404 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  29.56 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 419 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 419 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 419 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.64 
 
 		 424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 395 aa  114  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  25.5 
 
 		 423 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  25.5 
 
 		 423 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  25.5 
 
 		 423 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  25.5 
 
 		 423 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  27.96 
 
 		 423 aa  112  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  25.99 
 
 		 423 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.24 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  25.74 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 410 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.86 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 424 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  27 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 433 aa  97.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  24.52 
 
 		 432 aa  96.3  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  26.25 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  26.25 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 435 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25.25 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  24.56 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  25 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  24.81 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  23.02 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  24.87 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  25.07 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  25.07 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  25.07 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  24.6 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  25.07 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  24.06 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  24.78 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  21.16 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  25.06 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  24.02 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  22.01 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  24.81 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  24.81 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  23.1 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  24.69 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  23.88 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  24.5 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  22.28 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  24.69 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  24.75 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  20.62 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  20.62 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  20.62 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  24.75 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>