More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0403 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  51.71 
 
 		 636 aa  672    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  60.31 
 
 		 643 aa  776    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  55.56 
 
 		 804 aa  635    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  53.2 
 
 		 642 aa  672    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  54.21 
 
 		 637 aa  665    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  53.24 
 
 		 649 aa  643    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  68.26 
 
 		 654 aa  906    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  52.92 
 
 		 638 aa  653    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  51.11 
 
 		 665 aa  675    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  53.63 
 
 		 643 aa  667    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  51.01 
 
 		 653 aa  657    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  52.55 
 
 		 655 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  54.81 
 
 		 640 aa  671    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  52.52 
 
 		 654 aa  662    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  53.25 
 
 		 637 aa  664    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  54 
 
 		 650 aa  661    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  53.49 
 
 		 658 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  51.3 
 
 		 645 aa  659    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  54.97 
 
 		 640 aa  672    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  55.33 
 
 		 648 aa  674    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  54.97 
 
 		 640 aa  672    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  48.5 
 
 		 686 aa  643    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  54.66 
 
 		 640 aa  669    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  55.28 
 
 		 640 aa  671    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  53.64 
 
 		 641 aa  660    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  56.17 
 
 		 642 aa  676    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  70.34 
 
 		 651 aa  945    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  53.41 
 
 		 648 aa  660    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  70.22 
 
 		 652 aa  917    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  51.6 
 
 		 655 aa  659    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  55.35 
 
 		 650 aa  712    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  52.86 
 
 		 655 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  59.72 
 
 		 633 aa  732    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  55.12 
 
 		 645 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  53.26 
 
 		 651 aa  672    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  54.97 
 
 		 640 aa  672    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  55.33 
 
 		 642 aa  688    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  54.97 
 
 		 640 aa  672    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  58.05 
 
 		 649 aa  764    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  58.27 
 
 		 644 aa  751    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  53.22 
 
 		 655 aa  660    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  58.76 
 
 		 637 aa  747    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  53.94 
 
 		 655 aa  671    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  57.04 
 
 		 795 aa  635    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  55.37 
 
 		 635 aa  674    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  54.97 
 
 		 640 aa  672    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  51.7 
 
 		 633 aa  643    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  58.21 
 
 		 644 aa  763    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  51.89 
 
 		 655 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  54.19 
 
 		 645 aa  644    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  66.82 
 
 		 658 aa  875    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  55.26 
 
 		 634 aa  693    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  54.1 
 
 		 640 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  52.08 
 
 		 675 aa  686    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  55.81 
 
 		 640 aa  681    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  64.55 
 
 		 646 aa  865    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 659 aa  1358    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  53.54 
 
 		 645 aa  656    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  58.81 
 
 		 632 aa  741    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  52.57 
 
 		 636 aa  664    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1311  DNA gyrase subunit B  55.75 
 
 		 641 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  57.79 
 
 		 640 aa  686    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  54.97 
 
 		 640 aa  669    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  56.53 
 
 		 644 aa  716    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  52.66 
 
 		 644 aa  694    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  53.4 
 
 		 642 aa  665    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  71.56 
 
 		 652 aa  963    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  58.15 
 
 		 638 aa  698    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  58.31 
 
 		 638 aa  699    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  54.81 
 
 		 640 aa  668    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  55.17 
 
 		 640 aa  705    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  52.87 
 
 		 655 aa  667    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  58.64 
 
 		 644 aa  775    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  52.55 
 
 		 647 aa  660    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  53.99 
 
 		 633 aa  706    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  58.1 
 
 		 640 aa  691    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  52.59 
 
 		 634 aa  642    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  56.37 
 
 		 651 aa  687    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  57.25 
 
 		 636 aa  695    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  55.75 
 
 		 641 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  52.8 
 
 		 656 aa  667    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  55.76 
 
 		 635 aa  682    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  53.92 
 
 		 650 aa  657    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  55.21 
 
 		 645 aa  681    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  59.59 
 
 		 633 aa  734    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  58.31 
 
 		 628 aa  750    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  52.82 
 
 		 627 aa  637    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  54.24 
 
 		 641 aa  684    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  51.6 
 
 		 655 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  52.12 
 
 		 637 aa  672    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  52.88 
 
 		 636 aa  667    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  53.63 
 
 		 645 aa  639    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  59.09 
 
 		 643 aa  777    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  54.1 
 
 		 640 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  54.4 
 
 		 645 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  55.21 
 
 		 642 aa  682    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  69.3 
 
 		 651 aa  922    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  58.16 
 
 		 825 aa  645    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146448 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  58.03 
 
 		 638 aa  702    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  58.05 
 
 		 635 aa  698    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>