232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3343 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  100 
 
 		 289 aa  595  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  54.67 
 
 		 287 aa  329  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  38.14 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  39.18 
 
 		 291 aa  208  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  38.06 
 
 		 292 aa  198  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  37.46 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  34.81 
 
 		 293 aa  181  9.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  37.19 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  33.68 
 
 		 292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  35.69 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  34.71 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  34.36 
 
 		 286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  37.5 
 
 		 293 aa  165  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  30.03 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  34.39 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  36.71 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  36.71 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  35.76 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  35.42 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  35.42 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  35.42 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  35.42 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  35.42 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  30.27 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  35.07 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  35.07 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  29.79 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  30 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  31.9 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  33.22 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  26.62 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  29.68 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  30.31 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  29.08 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  32.01 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  30.14 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09150  hypothetical protein  27.46 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000277277  normal  0.476622 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09160  degV family protein  30.56 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.356982  normal  0.378413 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  32.39 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  28.17 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  33.69 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  30.66 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1150  degV family protein  29.37 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.444716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1941  degV family protein  25.95 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.0830662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  32.3 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  29.07 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  30.04 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  29.07 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  28.14 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  28.62 
 
 		 282 aa  118  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  29.41 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0982  degV family protein  29.21 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  28.82 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  30.66 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  28.62 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  27.34 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  29.02 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  27.4 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  27.86 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  30.28 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  28.47 
 
 		 285 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  26.55 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  27.6 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  26.33 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  30.74 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  27.56 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  28.27 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  27.37 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  31.25 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  27.08 
 
 		 280 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  27.18 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  27.66 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  25.95 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  27.68 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  29.73 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_903  DegV  29.15 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149031  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  27.4 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  27.66 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  28.17 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  26.83 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  30.53 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  28.52 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  26.83 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  27.46 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  29.47 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  26.83 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  26.83 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  30.99 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  29.39 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  28.82 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1346  degV family protein  26.46 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000423289  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  27.46 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  27.82 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  28.17 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  29.05 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  30.41 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  30.63 
 
 		 280 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  27.46 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  30.63 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>