83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3342 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  39.6 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225121 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  39.05 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  38.31 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  38.66 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  29.27 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  28.99 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  31.52 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  29.19 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  33.1 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  27.32 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  27.32 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  27.32 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  27.32 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  27.75 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  27.75 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  27.75 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  27.75 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  27.75 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  27.75 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  27.75 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  27.75 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  27.75 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  32.94 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  36.3 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  35.25 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  32.84 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  35.56 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  32.84 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  32.84 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  35.56 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  33.13 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  33.58 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37710  peptidase E  28.43 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  30.6 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  31.5 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  32.5 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  33.58 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  29.09 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  30.72 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  29.75 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0972  peptidase E  29.46 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1245  peptidase E  28.99 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  26.36 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4364  peptidase E  28.88 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0978  peptidase E  30.53 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  24.83 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  28.57 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1665  peptidase S51, dipeptidase E  25.74 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0948934  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1768  peptidase E  27.81 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  26.57 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09678  peptidase E  34.23 
 
 		 235 aa  52  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02207  peptidase E  30.37 
 
 		 234 aa  51.6  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0649813  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3140  peptidase S51 dipeptidase E  28 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1379  peptidase E  33.57 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  22.81 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10751  peptidase E  28.47 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.439295  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4173  peptidase E  37.33 
 
 		 249 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3280  peptidase E  29.55 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0167296 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2072  peptidase E  26.67 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1000  hypothetical protein  27.74 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0358258  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10751  peptidase E  27.74 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.293161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0257  peptidase E  26.81 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.109084 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  28.99 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1776  peptidase S51 dipeptidase E  25 
 
 		 280 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125751  normal  0.183168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1642  peptidase S51 dipeptidase E  28.99 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1788  hypothetical protein  28.26 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  28.57 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0201  peptidase S51 dipeptidase E  24.5 
 
 		 249 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1847  hypothetical protein  28.99 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174476  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1639  peptidase S51 dipeptidase E  25.55 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1824  hypothetical protein  28.99 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1643  hypothetical protein  28.99 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1622  peptidase E  28.99 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1592  peptidase E  28.99 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1774  hypothetical protein  28.99 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3556  hypothetical protein  27.54 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.230544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  25.83 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10721  peptidase E  27.74 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1676  peptidase S51 dipeptidase E  29.7 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2070  peptidase S51, dipeptidase E  20.95 
 
 		 259 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1935  peptidase S51 dipeptidase E  30.17 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000428456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3247  peptidase S51 dipeptidase E  24.43 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453471  normal  0.0137165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>