55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1245 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1245  peptidase E  100 
 
 		 234 aa  490  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2072  peptidase E  53.02 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  52.16 
 
 		 232 aa  249  4e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1379  peptidase E  49.57 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  51.08 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  50.22 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  48.18 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  48.18 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  48.18 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  48.18 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  46.19 
 
 		 235 aa  208  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  45.89 
 
 		 235 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  47.73 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  47.73 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  47.73 
 
 		 237 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  47.73 
 
 		 237 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  45.45 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  46.82 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  42.99 
 
 		 247 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  44.24 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  44.12 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  43.52 
 
 		 244 aa  178  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  41.4 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  41.4 
 
 		 229 aa  174  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  41.4 
 
 		 229 aa  174  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  41.4 
 
 		 229 aa  174  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4364  peptidase E  44.66 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  41.4 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  41.4 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  41.4 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  41.4 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  41.4 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  41.4 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  41.4 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  41.4 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  41.4 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02207  peptidase E  42.47 
 
 		 234 aa  171  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0649813  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1768  peptidase E  40.09 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  41.4 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0257  peptidase E  45.2 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.109084 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0978  peptidase E  37.93 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  38.1 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09678  peptidase E  37.67 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3280  peptidase E  34.8 
 
 		 234 aa  138  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0167296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4173  peptidase E  39.22 
 
 		 249 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  27.22 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  28.99 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  28.66 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  29.84 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  25.49 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  27.15 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  27.98 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  28.28 
 
 		 611 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02569  peptidase E  25.54 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10751  peptidase E  28.78 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.439295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>