42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1776 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1776  peptidase S51 dipeptidase E  100 
 
 
280 aa  551  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125751  normal  0.183168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3137  peptidase S51, dipeptidase E  80.89 
 
 
254 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.638284  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3365  peptidase S51 dipeptidase E  70.59 
 
 
244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225018  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3095  peptidase S51 dipeptidase E  58.82 
 
 
245 aa  266  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277898  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3782  peptidase S51, dipeptidase E  60.08 
 
 
243 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1620  peptidase S51 dipeptidase E  59.5 
 
 
243 aa  255  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511149  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02370  peptidase E  52.65 
 
 
247 aa  241  7.999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.946739  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0136  peptidase S51, dipeptidase E  55.82 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18450  peptidase E  52.65 
 
 
250 aa  229  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17206  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4161  peptidase S51 dipeptidase E  60.08 
 
 
243 aa  227  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1273  peptidase S51 dipeptidase E  55.08 
 
 
241 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2642  hypothetical protein  51.88 
 
 
245 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100609  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1268  peptidase S51 dipeptidase E  52.08 
 
 
248 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  0.51146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3283  peptidase S51 dipeptidase E  55.51 
 
 
243 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.413219  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0201  peptidase S51 dipeptidase E  46.4 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1676  peptidase S51 dipeptidase E  42.35 
 
 
194 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2070  peptidase S51, dipeptidase E  36.07 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00740  peptidase E  43.96 
 
 
240 aa  138  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0200  peptidase S51 dipeptidase E  43.78 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0394  hypothetical protein  31.09 
 
 
230 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10841  hypothetical protein  30.57 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103566  hitchhiker  0.00469942 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10721  peptidase E  29.44 
 
 
226 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1000  hypothetical protein  31.74 
 
 
226 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0358258  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10751  peptidase E  30 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.293161  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10751  peptidase E  30 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.439295  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1748  peptidase S51 dipeptidase E  37.13 
 
 
201 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02569  peptidase E  32.58 
 
 
207 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  25.15 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  22.39 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1847  hypothetical protein  22.39 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1824  hypothetical protein  22.39 
 
 
232 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1774  hypothetical protein  22.39 
 
 
232 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1592  peptidase E  22.39 
 
 
232 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1622  peptidase E  22.39 
 
 
232 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1643  hypothetical protein  22.39 
 
 
232 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1788  hypothetical protein  22.56 
 
 
232 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1642  peptidase S51 dipeptidase E  23.71 
 
 
232 aa  62.4  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3556  hypothetical protein  22.5 
 
 
232 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.230544  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1420  peptidase S51 dipeptidase E  22.77 
 
 
232 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  25 
 
 
204 aa  45.8  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  32.52 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  29.7 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>