44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3137 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3137  peptidase S51, dipeptidase E  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.638284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1776  peptidase S51 dipeptidase E  80.89 
 
 		 280 aa  400  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125751  normal  0.183168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3365  peptidase S51 dipeptidase E  69.33 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225018  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3782  peptidase S51, dipeptidase E  60.25 
 
 		 243 aa  274  8e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3095  peptidase S51 dipeptidase E  56.79 
 
 		 245 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277898  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4161  peptidase S51 dipeptidase E  59.84 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000119415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1620  peptidase S51 dipeptidase E  56.97 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511149  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02370  peptidase E  50.62 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0136  peptidase S51, dipeptidase E  54.51 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3283  peptidase S51 dipeptidase E  55.51 
 
 		 243 aa  221  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.413219  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2642  hypothetical protein  51.45 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1268  peptidase S51 dipeptidase E  50.62 
 
 		 248 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  0.51146 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18450  peptidase E  51.04 
 
 		 250 aa  215  7e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1273  peptidase S51 dipeptidase E  51.25 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0201  peptidase S51 dipeptidase E  42.86 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1676  peptidase S51 dipeptidase E  43.02 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0200  peptidase S51 dipeptidase E  43.37 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00740  peptidase E  46.63 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2070  peptidase S51, dipeptidase E  34.33 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0394  hypothetical protein  31.77 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10841  hypothetical protein  31.77 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103566  hitchhiker  0.00469942 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10721  peptidase E  30.53 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10751  peptidase E  31.19 
 
 		 226 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.293161  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1000  hypothetical protein  29.19 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0358258  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10751  peptidase E  30 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.439295  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1748  peptidase S51 dipeptidase E  37.13 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02569  peptidase E  34.1 
 
 		 207 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  24.88 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  24.62 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1847  hypothetical protein  23.76 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1774  hypothetical protein  23.76 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1824  hypothetical protein  23.76 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1622  peptidase E  23.76 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1643  hypothetical protein  23.76 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1592  peptidase E  23.76 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1788  hypothetical protein  24.31 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3556  hypothetical protein  23.89 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.230544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1642  peptidase S51 dipeptidase E  24.1 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1420  peptidase S51 dipeptidase E  22.77 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  33.9 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  36.25 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  37.5 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  31.87 
 
 		 230 aa  42.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  31.31 
 
 		 235 aa  42  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>