62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1567 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  100 
 
 		 235 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  74.47 
 
 		 235 aa  367  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  68.94 
 
 		 236 aa  347  9e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  71.06 
 
 		 235 aa  346  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  68.09 
 
 		 236 aa  344  7e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  68.09 
 
 		 236 aa  344  7e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  68.51 
 
 		 237 aa  342  4e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  68.09 
 
 		 237 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  68.09 
 
 		 237 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  67.23 
 
 		 236 aa  338  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  67.66 
 
 		 239 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  66.38 
 
 		 236 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  63.79 
 
 		 247 aa  325  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  54.59 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02207  peptidase E  50.64 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0649813  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1379  peptidase E  50.24 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1245  peptidase E  45.45 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  45.65 
 
 		 244 aa  198  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  46.7 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  43.56 
 
 		 251 aa  191  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2072  peptidase E  46.15 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1768  peptidase E  43.67 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  43.24 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  43.69 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  43.69 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  43.69 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  45.63 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  43.95 
 
 		 232 aa  181  6e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  42.86 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  42.86 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  42.86 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  42.86 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  42.86 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  42.86 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  42.86 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  42.86 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  42.86 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  45.29 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09678  peptidase E  41.2 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3280  peptidase E  39.22 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0167296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4364  peptidase E  48 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  41.41 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0257  peptidase E  43.53 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.109084 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0978  peptidase E  35.56 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4173  peptidase E  46.77 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  30.52 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  33.58 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  33.62 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  26.95 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  28.74 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  34.45 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  31.43 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  34.18 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  33.33 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  26.24 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10841  hypothetical protein  26.51 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103566  hitchhiker  0.00469942 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0394  hypothetical protein  27.22 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  32.94 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  25.93 
 
 		 294 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  26.79 
 
 		 287 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  26.79 
 
 		 287 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3137  peptidase S51, dipeptidase E  31.31 
 
 		 254 aa  42  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.638284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>