46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1000 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1000  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0358258  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10751  peptidase E  87.61 
 
 
226 aa  397  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.293161  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10751  peptidase E  86.73 
 
 
226 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.439295  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10721  peptidase E  75.66 
 
 
226 aa  342  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0394  hypothetical protein  49.03 
 
 
230 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10841  hypothetical protein  49.51 
 
 
230 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103566  hitchhiker  0.00469942 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1676  peptidase S51 dipeptidase E  44.5 
 
 
194 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0201  peptidase S51 dipeptidase E  35.17 
 
 
249 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2070  peptidase S51, dipeptidase E  39.33 
 
 
259 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02569  peptidase E  41.62 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  35.09 
 
 
242 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3095  peptidase S51 dipeptidase E  31.03 
 
 
245 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277898  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0200  peptidase S51 dipeptidase E  34.54 
 
 
262 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1268  peptidase S51 dipeptidase E  30.74 
 
 
248 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  0.51146 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18450  peptidase E  29.53 
 
 
250 aa  119  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17206  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1776  peptidase S51 dipeptidase E  29.76 
 
 
280 aa  118  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125751  normal  0.183168 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00740  peptidase E  30.85 
 
 
240 aa  118  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2642  hypothetical protein  34 
 
 
245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100609  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3137  peptidase S51, dipeptidase E  29.22 
 
 
254 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.638284  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3283  peptidase S51 dipeptidase E  28 
 
 
243 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.413219  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3365  peptidase S51 dipeptidase E  27.18 
 
 
244 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225018  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0136  peptidase S51, dipeptidase E  27.68 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02370  peptidase E  28.79 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.946739  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1273  peptidase S51 dipeptidase E  31.68 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3782  peptidase S51, dipeptidase E  28.79 
 
 
243 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1788  hypothetical protein  37.69 
 
 
232 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1642  peptidase S51 dipeptidase E  36.27 
 
 
232 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  33.93 
 
 
232 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3556  hypothetical protein  36.04 
 
 
232 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.230544  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1643  hypothetical protein  33.93 
 
 
232 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1622  peptidase E  33.93 
 
 
232 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1774  hypothetical protein  33.93 
 
 
232 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1847  hypothetical protein  33.93 
 
 
232 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174476  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1620  peptidase S51 dipeptidase E  29.88 
 
 
243 aa  105  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511149  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1824  hypothetical protein  33.93 
 
 
232 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1420  peptidase S51 dipeptidase E  32.99 
 
 
232 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1592  peptidase E  33.48 
 
 
232 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132542  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1748  peptidase S51 dipeptidase E  27.23 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4161  peptidase S51 dipeptidase E  28.65 
 
 
243 aa  85.9  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000119415 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37460  predicted protein  29.03 
 
 
211 aa  52  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  23.56 
 
 
269 aa  48.9  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  27.74 
 
 
204 aa  48.5  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  26.36 
 
 
269 aa  42.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  25.17 
 
 
207 aa  42.4  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  28.39 
 
 
204 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  34.69 
 
 
284 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>