29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1125 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  100 
 
 
207 aa  422  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0972  peptidase E  66.67 
 
 
159 aa  223  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  29.41 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225121 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  31.07 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  31.5 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  29.45 
 
 
222 aa  61.6  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  37.8 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  24.88 
 
 
204 aa  54.7  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  28.57 
 
 
230 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  28.69 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  24.68 
 
 
235 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3421  peptidase E-like protein  34.31 
 
 
208 aa  52.4  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  27.66 
 
 
231 aa  51.6  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37956  predicted protein  26.57 
 
 
382 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.834363  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3140  peptidase S51 dipeptidase E  25.93 
 
 
228 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  20.69 
 
 
204 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2868  conserved hypothetical conserved fusion protein  27.48 
 
 
228 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2070  peptidase S51, dipeptidase E  26.85 
 
 
259 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1665  peptidase S51, dipeptidase E  27.45 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0948934  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02569  peptidase E  29.47 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1429  cobyrinic acid a,c-diamide synthase CbiA  39.66 
 
 
447 aa  43.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  28.12 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1620  peptidase S51 dipeptidase E  21.43 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511149  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02370  peptidase E  26.55 
 
 
247 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.946739  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1935  peptidase S51 dipeptidase E  23.03 
 
 
221 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000428456  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1000  hypothetical protein  25.17 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0358258  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18450  peptidase E  25.93 
 
 
250 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17206  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10841  hypothetical protein  27.68 
 
 
230 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103566  hitchhiker  0.00469942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  24.81 
 
 
231 aa  41.6  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>