12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1935 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1935  peptidase S51 dipeptidase E  100 
 
 
221 aa  455  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000428456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3247  peptidase S51 dipeptidase E  56.11 
 
 
222 aa  256  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453471  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  34.25 
 
 
235 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  29.2 
 
 
222 aa  49.3  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3140  peptidase S51 dipeptidase E  30.16 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  27.84 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  30.17 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  23.03 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2868  conserved hypothetical conserved fusion protein  30.4 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  25.76 
 
 
204 aa  43.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  28.7 
 
 
279 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  24.29 
 
 
205 aa  42  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.912522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>