44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0633 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  100 
 
 		 235 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1935  peptidase S51 dipeptidase E  34.25 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000428456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3247  peptidase S51 dipeptidase E  33.64 
 
 		 222 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453471  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  34.9 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225121 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  25 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  28.65 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  30.69 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  31.02 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  24.83 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  32.37 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  24.68 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  26.32 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  32.85 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  25.87 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  25.29 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  27.52 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3140  peptidase S51 dipeptidase E  30.32 
 
 		 228 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  25.71 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  28.15 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  28.15 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  27.41 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  28.15 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  26.53 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  33.09 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0972  peptidase E  34.29 
 
 		 159 aa  48.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  28.89 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2868  conserved hypothetical conserved fusion protein  29.59 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  26.53 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  32.93 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1768  peptidase E  26.11 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  26.24 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  25.85 
 
 		 236 aa  45.1  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  25.85 
 
 		 236 aa  45.1  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0201  peptidase S51 dipeptidase E  29.73 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  25.95 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3280  peptidase E  28.15 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0167296 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1245  peptidase E  27.15 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09678  peptidase E  25.19 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2072  peptidase E  25.5 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  24.14 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0257  peptidase E  26.58 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.109084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02207  peptidase E  25.35 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0649813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  27.89 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  32.59 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>