59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2119 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  100 
 
 
222 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  46.7 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  50.23 
 
 
218 aa  201  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1665  peptidase S51, dipeptidase E  38.39 
 
 
228 aa  144  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0948934  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3421  peptidase E-like protein  41.08 
 
 
208 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2868  conserved hypothetical conserved fusion protein  34.85 
 
 
228 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3140  peptidase S51 dipeptidase E  35.35 
 
 
228 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  36.84 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  32.5 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  29.45 
 
 
207 aa  61.6  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  35.29 
 
 
251 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  26.47 
 
 
244 aa  58.5  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  37.35 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  29.13 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0972  peptidase E  33.33 
 
 
159 aa  55.1  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  38.27 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  33.06 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  32.65 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  32.99 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  32.99 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  32.99 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  31.3 
 
 
236 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  29.8 
 
 
251 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  32.58 
 
 
229 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  32.99 
 
 
229 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  32.58 
 
 
229 aa  52  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  32.58 
 
 
229 aa  52  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  32.58 
 
 
229 aa  52  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  32.58 
 
 
229 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  32.58 
 
 
229 aa  52  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  32.58 
 
 
229 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  32.58 
 
 
229 aa  52  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  32.58 
 
 
229 aa  52  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  38.27 
 
 
235 aa  52  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  40.74 
 
 
235 aa  52  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  34.45 
 
 
235 aa  51.6  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  29.73 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4173  peptidase E  41.89 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1935  peptidase S51 dipeptidase E  29.2 
 
 
221 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000428456  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  37.04 
 
 
323 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  34.94 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  33.33 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1642  peptidase S51 dipeptidase E  24.77 
 
 
232 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5501  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  25.49 
 
 
204 aa  45.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  34.57 
 
 
237 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  33.33 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  33.82 
 
 
348 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  33.33 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  34.57 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  34.57 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  33.33 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2072  peptidase E  29.17 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  23.78 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  32.1 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  33.33 
 
 
247 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  28.57 
 
 
294 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0978  peptidase E  27.7 
 
 
245 aa  42.4  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  27.05 
 
 
287 aa  41.6  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  28.05 
 
 
346 aa  41.6  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>