18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2868 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2868  conserved hypothetical conserved fusion protein  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3140  peptidase S51 dipeptidase E  85.96 
 
 		 228 aa  400  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  34.85 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  37.88 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1665  peptidase S51, dipeptidase E  29.67 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0948934  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  28.07 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3421  peptidase E-like protein  33.89 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  27.18 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  28.31 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  27.48 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  29.59 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  22.62 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  24 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37710  peptidase E  36 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  19.89 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  25.61 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1935  peptidase S51 dipeptidase E  30.4 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000428456  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  30.66 
 
 		 204 aa  42  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>