57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2497 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  100 
 
 
231 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  46.7 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  45.37 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1665  peptidase S51, dipeptidase E  36.75 
 
 
228 aa  152  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0948934  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3421  peptidase E-like protein  38.67 
 
 
208 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2868  conserved hypothetical conserved fusion protein  28.07 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3140  peptidase S51 dipeptidase E  36.57 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  29.93 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  31.86 
 
 
244 aa  55.8  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  32.48 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  32.48 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  32.48 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  32.48 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0530108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  32.48 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  32.48 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  32.48 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  32.48 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  32.48 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  29.09 
 
 
204 aa  52.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225121 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  34.41 
 
 
231 aa  52.4  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  26.57 
 
 
204 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  27.88 
 
 
204 aa  52  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0972  peptidase E  34.04 
 
 
159 aa  52  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  37.5 
 
 
251 aa  52  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  28.57 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  27.66 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  36.36 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  28.3 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  35 
 
 
251 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  28.48 
 
 
204 aa  49.3  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  35 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  27.67 
 
 
229 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  27.67 
 
 
229 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  27.67 
 
 
229 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  36.25 
 
 
247 aa  48.5  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  35 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  34.18 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  35 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  31.67 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  35 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  35 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  35 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  36.25 
 
 
239 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  34.18 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  32.93 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  36.25 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  36.25 
 
 
237 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1639  peptidase S51 dipeptidase E  26.11 
 
 
234 aa  45.8  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  33.75 
 
 
236 aa  45.1  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0257  peptidase E  32 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.109084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  31.25 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4173  peptidase E  33.33 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0978  peptidase E  37.23 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02207  peptidase E  35.44 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0649813  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  31.96 
 
 
348 aa  43.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2072  peptidase E  31.31 
 
 
232 aa  42.7  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  27.96 
 
 
232 aa  42  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>