40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1599 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  100 
 
 
218 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  50.23 
 
 
222 aa  201  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  45.37 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1665  peptidase S51, dipeptidase E  39.09 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0948934  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3140  peptidase S51 dipeptidase E  42.11 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3421  peptidase E-like protein  38.92 
 
 
208 aa  108  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2868  conserved hypothetical conserved fusion protein  37.88 
 
 
228 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  26.36 
 
 
204 aa  58.2  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  29.38 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  24.84 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  24.56 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  31.07 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  28.69 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  29.05 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  31.25 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  31.25 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  28.06 
 
 
251 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  27.93 
 
 
231 aa  48.5  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  35.37 
 
 
235 aa  48.5  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  31.25 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  28.89 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  29.61 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  30.53 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  30.63 
 
 
231 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  25.86 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  33.33 
 
 
235 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  26.21 
 
 
251 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  26.35 
 
 
236 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  28.71 
 
 
244 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  33.33 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  28.95 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  29.01 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  32.14 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  25 
 
 
229 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  25 
 
 
229 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  25 
 
 
229 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  25 
 
 
229 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  30.71 
 
 
297 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  32.31 
 
 
323 aa  42  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0978  peptidase E  28.95 
 
 
245 aa  42  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>