51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0514 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  100 
 
 		 291 aa  589  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  44.77 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  34.18 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  33.09 
 
 		 274 aa  155  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  35.36 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  32.14 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  34.97 
 
 		 284 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  34.17 
 
 		 288 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  31.75 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  32.74 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  33.09 
 
 		 280 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  29.86 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  30.17 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  30.17 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  31.39 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  29.86 
 
 		 269 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  31.15 
 
 		 287 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  31 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  30.84 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  29.26 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  30.04 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  30.94 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  30.4 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  31.02 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  29.18 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  32.05 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  27.06 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  27.82 
 
 		 328 aa  99  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  26.78 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  26 
 
 		 458 aa  79  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  34.67 
 
 		 611 aa  70.1  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  27.64 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  29.25 
 
 		 474 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  29.1 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  28.29 
 
 		 339 aa  58.9  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  32.34 
 
 		 559 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  29.71 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  27.66 
 
 		 340 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2868  conserved hypothetical conserved fusion protein  27.18 
 
 		 228 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  25.65 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1651  peptidase S51, dipeptidase E  31.91 
 
 		 369 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588878  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3140  peptidase S51 dipeptidase E  25.73 
 
 		 228 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  24.89 
 
 		 418 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  25.09 
 
 		 587 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  25.74 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1987  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  30.72 
 
 		 541 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2050  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  30.72 
 
 		 541 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338236  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2337  Cyanophycinase and related exopeptidase-like protein  31.17 
 
 		 598 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.704877  normal  0.140679 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1689  cyanophycinase-like protein  28.93 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2002  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  31.17 
 
 		 541 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.083735  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  28.76 
 
 		 323 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>