46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4153 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  100 
 
 		 289 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  44.77 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  39.35 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  33.81 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  35.04 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  36.43 
 
 		 280 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  35.71 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  35.71 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  34.67 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  35.15 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  35.14 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  33.21 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  34.44 
 
 		 287 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  34.85 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  34.02 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  31.43 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  34.31 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  32.85 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  32.36 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  33.33 
 
 		 281 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  33.09 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  32.72 
 
 		 289 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  30.18 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  33.33 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  30.07 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  30.07 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  33.94 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  31.52 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  31.05 
 
 		 328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  30.4 
 
 		 458 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  31.71 
 
 		 611 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  28.75 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  27.27 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  27.32 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  25.91 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  25.45 
 
 		 587 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  25.79 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  21.98 
 
 		 348 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  24.6 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  29.07 
 
 		 559 aa  49.7  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  24.2 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  27.05 
 
 		 418 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10751  peptidase E  23.3 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.439295  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1900  cyanophycinase-like protein  26.03 
 
 		 348 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147675  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1651  peptidase S51, dipeptidase E  26.46 
 
 		 369 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588878  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  25.27 
 
 		 340 aa  42.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>