44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2919 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  100 
 
 
474 aa  965    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  47.79 
 
 
458 aa  324  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  30.13 
 
 
587 aa  128  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  31.27 
 
 
280 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  31.88 
 
 
273 aa  101  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  30.74 
 
 
289 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  32.97 
 
 
288 aa  98.2  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  28.83 
 
 
269 aa  97.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  28.07 
 
 
274 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  31.71 
 
 
273 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  29.26 
 
 
278 aa  90.1  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  31.87 
 
 
327 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  30.07 
 
 
287 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  30.07 
 
 
287 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  30.37 
 
 
284 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  29.51 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  30.18 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  27.92 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  31.29 
 
 
269 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  30.77 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  27.49 
 
 
294 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  28.82 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  30.54 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  27.92 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  29.9 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  28.88 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  27.27 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  29.41 
 
 
275 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  28.36 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  29.03 
 
 
611 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  25.42 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  27.08 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  27.5 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  29.25 
 
 
291 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  27.37 
 
 
317 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  24.1 
 
 
418 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  27.34 
 
 
323 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2283  cyanophycinase and related exopeptidase-like  28.92 
 
 
331 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  31.4 
 
 
339 aa  50.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  26.44 
 
 
346 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  25.73 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1900  cyanophycinase-like protein  28.5 
 
 
348 aa  48.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147675  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  25.48 
 
 
348 aa  47  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  23.25 
 
 
333 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>