60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0874 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  100 
 
 
294 aa  604  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  81.85 
 
 
287 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  81.85 
 
 
287 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  66.67 
 
 
287 aa  397  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  66.91 
 
 
287 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  61.37 
 
 
291 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  59.79 
 
 
297 aa  361  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  49.44 
 
 
289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  40.7 
 
 
274 aa  195  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  40.15 
 
 
288 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  42.64 
 
 
273 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  38.83 
 
 
273 aa  193  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  39.27 
 
 
275 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  39.53 
 
 
278 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  38.91 
 
 
269 aa  186  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  39.23 
 
 
293 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  35.92 
 
 
284 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  39.92 
 
 
280 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  39.53 
 
 
327 aa  175  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  34.46 
 
 
274 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  37.59 
 
 
281 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  34.11 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  36.12 
 
 
278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  32.23 
 
 
284 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  35 
 
 
269 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  35.77 
 
 
328 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  34.85 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  31.25 
 
 
279 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  30.84 
 
 
291 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  29.45 
 
 
611 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  32.81 
 
 
458 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  27.33 
 
 
295 aa  95.9  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  29.39 
 
 
339 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  26.34 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  27.49 
 
 
474 aa  79.3  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  28.64 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  26.96 
 
 
559 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  28.73 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0221  peptidase S51 dipeptidase E  28.9 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1689  cyanophycinase-like protein  28 
 
 
374 aa  64.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2283  cyanophycinase and related exopeptidase-like  25.44 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  25.97 
 
 
587 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  25.89 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  24.77 
 
 
346 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2002  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  25.49 
 
 
541 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.083735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2337  Cyanophycinase and related exopeptidase-like protein  25.16 
 
 
598 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.704877  normal  0.140679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2050  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  26 
 
 
541 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338236  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  24.87 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1987  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  25.6 
 
 
541 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1900  cyanophycinase-like protein  26.41 
 
 
348 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147675  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  24.78 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1651  peptidase S51, dipeptidase E  29.09 
 
 
369 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588878  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2840  cyanophycinase-like protein  27.63 
 
 
338 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.437386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3283  putative peptidase  27.63 
 
 
338 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1639  peptidase S51 dipeptidase E  31.52 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  26.36 
 
 
323 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2036  hypothetical protein  33.8 
 
 
253 aa  45.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  hitchhiker  0.00824459 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3268  cyanophycinase-like protein  26.32 
 
 
423 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.890321  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  25.93 
 
 
235 aa  43.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  28.57 
 
 
222 aa  42.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>