60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2205 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  100 
 
 		 269 aa  547  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  65.4 
 
 		 269 aa  351  5.9999999999999994e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  58.71 
 
 		 274 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  57.09 
 
 		 273 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  50.75 
 
 		 273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  48.45 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  49.61 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  48.48 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  49.22 
 
 		 275 aa  244  9e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  48.08 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  46.15 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  45.83 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  43.98 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  39.23 
 
 		 284 aa  201  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  38.17 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  39.62 
 
 		 327 aa  185  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  38.46 
 
 		 293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  35.11 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  34.73 
 
 		 287 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  34.72 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  34.72 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  35.98 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  32.95 
 
 		 297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  34.11 
 
 		 294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  36.33 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  33.33 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  32.57 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  31.75 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  32.36 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  33.33 
 
 		 611 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  29.36 
 
 		 323 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  31.68 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  40.27 
 
 		 458 aa  93.2  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  29.73 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  28.63 
 
 		 348 aa  82  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  30.77 
 
 		 474 aa  80.5  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  30.58 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  27.1 
 
 		 587 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  31.31 
 
 		 418 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  30.06 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  29.15 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  27.84 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2283  cyanophycinase and related exopeptidase-like  23.51 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  30 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1900  cyanophycinase-like protein  29.71 
 
 		 348 aa  57  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147675  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  27.74 
 
 		 559 aa  55.8  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1639  peptidase S51 dipeptidase E  30 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0221  peptidase S51 dipeptidase E  24.2 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2840  cyanophycinase-like protein  30.37 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.437386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3283  putative peptidase  30.37 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  25.81 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2337  Cyanophycinase and related exopeptidase-like protein  26 
 
 		 598 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.704877  normal  0.140679 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10751  peptidase E  25.16 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.439295  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2002  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  26.5 
 
 		 541 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.083735  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1689  cyanophycinase-like protein  29.29 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1268  peptidase S51 dipeptidase E  21.9 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  0.51146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2050  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  29.73 
 
 		 541 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338236  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10751  peptidase E  23.9 
 
 		 226 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.293161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2642  hypothetical protein  22.22 
 
 		 245 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1987  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  26.26 
 
 		 541 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>