57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2731 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  100 
 
 
295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  52.72 
 
 
317 aa  300  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  41.18 
 
 
611 aa  175  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  31.3 
 
 
273 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  32.09 
 
 
284 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  31.52 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  32.86 
 
 
274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  30.45 
 
 
269 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  29.21 
 
 
281 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  31.34 
 
 
280 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  30.08 
 
 
323 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  28.94 
 
 
278 aa  99  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  29.79 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  28.87 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  30.27 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  31.41 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  30.71 
 
 
274 aa  95.9  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  27.33 
 
 
294 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  30.4 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  31.06 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  28.46 
 
 
297 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  27.82 
 
 
275 aa  92.4  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  28.47 
 
 
287 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  27.86 
 
 
587 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  29.33 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  29.33 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  27.38 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  29.73 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  28.79 
 
 
279 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  25.94 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  27.39 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  28.75 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  27.47 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  25.99 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  26.18 
 
 
346 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  25.42 
 
 
474 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  27.71 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  27.64 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  27.68 
 
 
348 aa  63.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  24.91 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  23.21 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1651  peptidase S51, dipeptidase E  25.11 
 
 
369 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588878  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1420  peptidase S51 dipeptidase E  24.53 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0221  peptidase S51 dipeptidase E  26.94 
 
 
229 aa  49.3  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  26.47 
 
 
418 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2283  cyanophycinase and related exopeptidase-like  22.92 
 
 
331 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  21.3 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1788  hypothetical protein  24.19 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1642  peptidase S51 dipeptidase E  22.54 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  22.75 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  25.25 
 
 
232 aa  44.3  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1847  hypothetical protein  22.75 
 
 
232 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1824  hypothetical protein  22.75 
 
 
232 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1774  hypothetical protein  22.75 
 
 
232 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1622  peptidase E  22.75 
 
 
232 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1643  hypothetical protein  22.75 
 
 
232 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1592  peptidase E  22.75 
 
 
232 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>