50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4208 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  100 
 
 
333 aa  684    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1900  cyanophycinase-like protein  42.12 
 
 
348 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2283  cyanophycinase and related exopeptidase-like  42.21 
 
 
331 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  38.51 
 
 
339 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  38.8 
 
 
348 aa  162  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1651  peptidase S51, dipeptidase E  38.83 
 
 
369 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588878  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  35.33 
 
 
323 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  35.84 
 
 
346 aa  153  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  34.41 
 
 
340 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3283  putative peptidase  31.01 
 
 
338 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2840  cyanophycinase-like protein  31.01 
 
 
338 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.437386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3268  cyanophycinase-like protein  30.77 
 
 
423 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.890321  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1689  cyanophycinase-like protein  32.22 
 
 
374 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3909  putative peptidase  35.03 
 
 
217 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  30.96 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  29.61 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  27.71 
 
 
284 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  27.44 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  28.87 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  27.93 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  26.82 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  27.48 
 
 
278 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  27.49 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  26.81 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  29.95 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  26.07 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  27.2 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  24.15 
 
 
288 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  27.32 
 
 
274 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  28.09 
 
 
269 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  27.84 
 
 
269 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  25.45 
 
 
280 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  24.87 
 
 
294 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  28.81 
 
 
293 aa  56.2  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  29.08 
 
 
559 aa  55.8  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  23.91 
 
 
273 aa  55.8  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  26.56 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  26.11 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  23.67 
 
 
287 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  23.67 
 
 
287 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  27.56 
 
 
291 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  26.44 
 
 
317 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  24.17 
 
 
323 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  21.3 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  22.33 
 
 
611 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  25.74 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  23.25 
 
 
474 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  26.51 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  39.13 
 
 
230 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  28.22 
 
 
458 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>