55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2478 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  100 
 
 		 278 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  98.18 
 
 		 275 aa  542  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  48.85 
 
 		 281 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  49.61 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  47.57 
 
 		 273 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  46.39 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  45.86 
 
 		 274 aa  228  7e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  47.84 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  44.06 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  42.59 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  42.21 
 
 		 288 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  39.18 
 
 		 284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  41.02 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  39.39 
 
 		 287 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  39.39 
 
 		 287 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  39.53 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  37.55 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  34.83 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  38.78 
 
 		 287 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  36.82 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  35.41 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  37.21 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  34.21 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  36.47 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  32.84 
 
 		 289 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  31.77 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  31.77 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  30.07 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  30.94 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  29.13 
 
 		 611 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  34.52 
 
 		 458 aa  90.1  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  29.38 
 
 		 317 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  27.38 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  32.52 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0221  peptidase S51 dipeptidase E  25.64 
 
 		 229 aa  78.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  27.43 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  29.9 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  26.82 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  29.19 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  27.48 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  28.65 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  28.86 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  28.64 
 
 		 587 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1420  peptidase S51 dipeptidase E  25.59 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  29.56 
 
 		 559 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  23.16 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1651  peptidase S51, dipeptidase E  27.9 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588878  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1900  cyanophycinase-like protein  26.44 
 
 		 348 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2283  cyanophycinase and related exopeptidase-like  20.75 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1639  peptidase S51 dipeptidase E  28.03 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2050  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  28.31 
 
 		 541 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338236  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2002  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  29.06 
 
 		 541 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.083735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2337  Cyanophycinase and related exopeptidase-like protein  28.86 
 
 		 598 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.704877  normal  0.140679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1987  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  29.06 
 
 		 541 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3253  hypothetical protein  33.03 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>