48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2878 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  100 
 
 		 458 aa  911    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  47.67 
 
 		 474 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  34.33 
 
 		 288 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  30 
 
 		 587 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  35.52 
 
 		 278 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  34.89 
 
 		 273 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  32.08 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  32.05 
 
 		 273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  28.98 
 
 		 284 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  32.38 
 
 		 274 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  31.34 
 
 		 280 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  29.26 
 
 		 269 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  33.33 
 
 		 327 aa  103  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  32.38 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  29.89 
 
 		 274 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  30.17 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  32.81 
 
 		 287 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  32.81 
 
 		 287 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  33.75 
 
 		 294 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  27.52 
 
 		 291 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  32.64 
 
 		 611 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  39.25 
 
 		 281 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  30.56 
 
 		 289 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  40.27 
 
 		 269 aa  93.2  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  36.29 
 
 		 284 aa  91.3  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  27.9 
 
 		 287 aa  91.3  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  27.54 
 
 		 287 aa  91.3  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  34.52 
 
 		 278 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  32.84 
 
 		 293 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  34.52 
 
 		 275 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  30.45 
 
 		 269 aa  86.7  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  28.07 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  25.64 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  29.8 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  26 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  28.12 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  32.12 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  35.4 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2283  cyanophycinase and related exopeptidase-like  25.74 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  27.06 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  30.59 
 
 		 339 aa  53.5  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  28.14 
 
 		 348 aa  53.5  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  23.01 
 
 		 232 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1847  hypothetical protein  23.01 
 
 		 232 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  28.85 
 
 		 559 aa  47.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1642  peptidase S51 dipeptidase E  23.45 
 
 		 232 aa  47  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5501  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0221  peptidase S51 dipeptidase E  32.2 
 
 		 229 aa  44.3  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  28.22 
 
 		 333 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>