22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3140 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3140  peptidase S51 dipeptidase E  100 
 
 		 228 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2868  conserved hypothetical conserved fusion protein  85.96 
 
 		 228 aa  400  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  35.35 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  42.11 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1665  peptidase S51, dipeptidase E  32.13 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0948934  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  36.57 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3421  peptidase E-like protein  38.06 
 
 		 208 aa  85.1  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  26 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  28 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  25.93 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  25.73 
 
 		 291 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  30.32 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  22.73 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  25.62 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  29.29 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1935  peptidase S51 dipeptidase E  30.16 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000428456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  23.78 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  26.52 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1589  peptidase E  22.73 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3247  peptidase S51 dipeptidase E  26.62 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453471  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37710  peptidase E  37.33 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  23.17 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>