23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3421 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3421  peptidase E-like protein  100 
 
 		 208 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  41.08 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  38.92 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  38.67 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1665  peptidase S51, dipeptidase E  32.53 
 
 		 228 aa  94.7  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0948934  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3140  peptidase S51 dipeptidase E  38.06 
 
 		 228 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2868  conserved hypothetical conserved fusion protein  33.89 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  39.22 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  34.31 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  37.65 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225121 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  34.48 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0972  peptidase E  30.25 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  36.14 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  39.74 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  27.98 
 
 		 251 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  32.41 
 
 		 230 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  25.67 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  34.62 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  32.97 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  27.5 
 
 		 252 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  24.84 
 
 		 287 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4173  peptidase E  38.16 
 
 		 249 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  24.84 
 
 		 287 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>