23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0972 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0972  peptidase E  100 
 
 
159 aa  327  5.0000000000000004e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  66.67 
 
 
207 aa  223  6e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  38.46 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  40.7 
 
 
230 aa  67.4  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  39.02 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  29.46 
 
 
204 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  29.29 
 
 
204 aa  58.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  33.33 
 
 
222 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  34.04 
 
 
231 aa  52  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3421  peptidase E-like protein  30.25 
 
 
208 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  31.63 
 
 
204 aa  49.7  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  34.29 
 
 
235 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1639  peptidase S51 dipeptidase E  34.83 
 
 
234 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  28.36 
 
 
205 aa  47.4  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37956  predicted protein  34.69 
 
 
382 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.834363  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  27.72 
 
 
242 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1245  peptidase E  34.12 
 
 
234 aa  41.6  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  26.45 
 
 
218 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1935  peptidase S51 dipeptidase E  28.57 
 
 
221 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000428456  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  27.83 
 
 
236 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02569  peptidase E  25.86 
 
 
207 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  27.38 
 
 
274 aa  40.4  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10841  hypothetical protein  27.2 
 
 
230 aa  40.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103566  hitchhiker  0.00469942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>