55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1448 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  100 
 
 		 230 aa  458  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  38.41 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37710  peptidase E  41.3 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  35.25 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  28.99 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  30.43 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  27.91 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  41.98 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225121 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0972  peptidase E  40.7 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  29.38 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  41.38 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  33.06 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  30.3 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  37.93 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  28.57 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  34.41 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  30.4 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  28.57 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1768  peptidase E  25 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  31.43 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  32.2 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  32.2 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  32.2 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  33.09 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  29.46 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  34 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09678  peptidase E  29.76 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  32.2 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1665  peptidase S51, dipeptidase E  32.18 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0948934  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  26.79 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1245  peptidase E  25.49 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  33.33 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  33.33 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  33.33 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  33.33 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  33.33 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  33.33 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  33.33 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  33.33 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3421  peptidase E-like protein  32.41 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  27.96 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  31.25 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  30.69 
 
 		 244 aa  45.1  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  35.48 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2070  peptidase S51, dipeptidase E  24.1 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1379  peptidase E  25.16 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37956  predicted protein  36.56 
 
 		 382 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.834363  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  31.25 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  31.25 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  31.96 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1750  glutamine amidotransferase subunit PdxT  28.95 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0201  peptidase S51 dipeptidase E  28.57 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  31.78 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  32.99 
 
 		 287 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>