57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2513 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  100 
 
 		 236 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  97.88 
 
 		 236 aa  476  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  97.88 
 
 		 236 aa  476  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  93.64 
 
 		 236 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  91.53 
 
 		 237 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  91.53 
 
 		 237 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  90.25 
 
 		 237 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  89.83 
 
 		 239 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  84.32 
 
 		 236 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  72.02 
 
 		 247 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  73.19 
 
 		 235 aa  371  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  70.64 
 
 		 235 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  68.94 
 
 		 235 aa  347  9e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  54.15 
 
 		 231 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02207  peptidase E  51.28 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0649813  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1245  peptidase E  48.18 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  47.39 
 
 		 244 aa  201  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  46.73 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1379  peptidase E  49.52 
 
 		 234 aa  197  7.999999999999999e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  45.95 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  45 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2072  peptidase E  42.86 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  41.99 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  41.26 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  41.26 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  41.26 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  41.26 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  41.26 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  41.26 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  41.26 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  41.26 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  41.26 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1768  peptidase E  42.92 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  39.91 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  39.91 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  39.91 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  39.91 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09678  peptidase E  37.45 
 
 		 235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4364  peptidase E  45.45 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3280  peptidase E  38.79 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0167296 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  40.83 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0978  peptidase E  42.08 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4173  peptidase E  39.34 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  38.19 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0257  peptidase E  38.24 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.109084 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  31.17 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  32.84 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  40.48 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  30.83 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  37.38 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  35 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  30.43 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  31.25 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  26.53 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  33.33 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  31.25 
 
 		 230 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02220  imidazole glycerol phosphate synthase, glutamine amidotransferase subunit  36.49 
 
 		 207 aa  42  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>