63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1683 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  100 
 
 		 252 aa  498  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4173  peptidase E  60.89 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1768  peptidase E  40.83 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  44.49 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09678  peptidase E  43.56 
 
 		 235 aa  185  7e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  43.27 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3280  peptidase E  41.77 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0167296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  43.23 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  43.23 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  43.23 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  42.79 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  42.36 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  42.36 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  42.36 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  42.36 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  42.36 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  42.36 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  42.36 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  42.36 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  42.36 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  44.66 
 
 		 251 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  41.26 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2072  peptidase E  37.24 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  43.15 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  40.91 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  41.47 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  41.41 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1245  peptidase E  38.1 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  42.42 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1379  peptidase E  38.5 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  38.19 
 
 		 236 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  38.19 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  38.19 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  37.62 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  37.88 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  38.19 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02207  peptidase E  43 
 
 		 234 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0649813  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  37.37 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  37.37 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  37.37 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  36.87 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  42.17 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0978  peptidase E  40.2 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4364  peptidase E  46.82 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0257  peptidase E  38.12 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.109084 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  27.45 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  29.85 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  33.7 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  44.71 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  38.27 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  28.57 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  37.93 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  32.85 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  34.18 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10841  hypothetical protein  27.63 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103566  hitchhiker  0.00469942 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0394  hypothetical protein  28.86 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1665  peptidase S51, dipeptidase E  29.67 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0948934  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1676  peptidase S51 dipeptidase E  28.35 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00740  peptidase E  31.47 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  30.54 
 
 		 204 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225121 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10751  peptidase E  23.08 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.439295  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  32.14 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3421  peptidase E-like protein  27.5 
 
 		 208 aa  42  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>