52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0978 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0978  peptidase E  100 
 
 
245 aa  507  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0257  peptidase E  44.49 
 
 
241 aa  237  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.109084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  46.47 
 
 
244 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  39.92 
 
 
251 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  42.41 
 
 
251 aa  174  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  41.2 
 
 
229 aa  171  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  41.2 
 
 
229 aa  171  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  41.2 
 
 
229 aa  171  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  41.2 
 
 
229 aa  171  9e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  41.2 
 
 
229 aa  171  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  41.2 
 
 
229 aa  171  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  41.2 
 
 
229 aa  171  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  41.2 
 
 
229 aa  171  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  41.2 
 
 
229 aa  171  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  39.48 
 
 
229 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  39.48 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  39.48 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  39.48 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  44.55 
 
 
235 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  40.67 
 
 
231 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02207  peptidase E  38.93 
 
 
234 aa  156  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0649813  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  43.84 
 
 
236 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  43.84 
 
 
236 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2072  peptidase E  40.74 
 
 
232 aa  151  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  42.13 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  41.67 
 
 
232 aa  150  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  42.38 
 
 
237 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  37.61 
 
 
236 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  42.86 
 
 
237 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  42.36 
 
 
236 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  42.42 
 
 
231 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  42.38 
 
 
239 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  42.86 
 
 
237 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  42.08 
 
 
236 aa  149  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  41.79 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1245  peptidase E  37.93 
 
 
234 aa  146  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  38.03 
 
 
230 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4364  peptidase E  43.23 
 
 
237 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  35.56 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3280  peptidase E  39.3 
 
 
234 aa  135  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0167296 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1768  peptidase E  34.57 
 
 
235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09678  peptidase E  37.44 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  40.2 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4173  peptidase E  38.82 
 
 
249 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1379  peptidase E  40 
 
 
234 aa  124  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  30.53 
 
 
204 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  36.67 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  30.43 
 
 
205 aa  48.9  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  35.78 
 
 
206 aa  48.9  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  37.23 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  27.7 
 
 
222 aa  42.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  28.95 
 
 
218 aa  42  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>