52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3280 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3280  peptidase E  100 
 
 
234 aa  478  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0167296 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1768  peptidase E  59.05 
 
 
235 aa  307  8e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  62.5 
 
 
230 aa  300  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09678  peptidase E  57.89 
 
 
235 aa  283  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  41.77 
 
 
252 aa  174  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4173  peptidase E  44.26 
 
 
249 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  39.91 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  39.91 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  39.91 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  39.91 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  39.91 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  39.91 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  39.91 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  39.91 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  39.91 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  39.47 
 
 
229 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  39.47 
 
 
229 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  39.47 
 
 
229 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  39.47 
 
 
229 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  39.22 
 
 
235 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  39.22 
 
 
237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  39.22 
 
 
239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  39.22 
 
 
237 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  39.22 
 
 
237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  41.38 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  37.5 
 
 
236 aa  162  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  38.79 
 
 
236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  37.08 
 
 
247 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  38.03 
 
 
236 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  38.1 
 
 
244 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  37.93 
 
 
236 aa  158  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  37.93 
 
 
236 aa  158  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  37.07 
 
 
235 aa  156  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  38.57 
 
 
231 aa  155  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02207  peptidase E  39.48 
 
 
234 aa  155  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0649813  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  39.37 
 
 
231 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2072  peptidase E  37.13 
 
 
232 aa  151  8.999999999999999e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  36.29 
 
 
232 aa  149  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1245  peptidase E  34.8 
 
 
234 aa  138  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  39.9 
 
 
251 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0978  peptidase E  39.3 
 
 
245 aa  135  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  41.57 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1379  peptidase E  36.36 
 
 
234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0257  peptidase E  38.73 
 
 
241 aa  128  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.109084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4364  peptidase E  42.22 
 
 
237 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  31.1 
 
 
204 aa  61.6  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  27.21 
 
 
205 aa  53.5  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  29.55 
 
 
204 aa  48.9  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  29.07 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  28.15 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1676  peptidase S51 dipeptidase E  30.63 
 
 
194 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1197  peptidase S51 dipeptidase E  29.66 
 
 
204 aa  42  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>